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111222000金蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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關(guān)于靜電勢(shì)的強(qiáng)弱問(wèn)題？ 已有4人參與
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請(qǐng)教各位，關(guān)于下面這個(gè)靜電勢(shì)的圖形，可不可以說(shuō)：正的靜電勢(shì)因?yàn)槊娣e比例大，顏色深，所以要比負(fù)的靜電勢(shì)強(qiáng)度大？能不能根據(jù)顏色深淺判斷強(qiáng)度大小？謝謝大家 7`R4{CN7(@%}V_$KW$(JWC7.jpg [ Last edited by 111222000 on 2013-3-7 at 17:42 ] |
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sobereva
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zhou2009: 金幣+4 2013-03-10 14:17:54
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不對(duì)照色彩刻度就沒(méi)法知道分子表面靜電勢(shì)圖的各種顏色對(duì)應(yīng)多大數(shù)值。 比如下面這張圖 可見(jiàn)色彩刻度軸是從-40到48 (kcal/mol)，色彩漸變是：藍(lán)-白-紅。因此，在分子表面上，靜電勢(shì)為-40以及更負(fù)的區(qū)域?qū)?yīng)的都是藍(lán)色，較負(fù)的區(qū)域是淡藍(lán)色（越負(fù)藍(lán)色越深），較正的區(qū)域是淡紅色（越正紅色越深），>=48的區(qū)域都是紅色。 |
4樓2013-03-10 12:13:21
sobereva
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顯示的時(shí)候在representation里把點(diǎn)的大小改大一些，讓他們相互交疊起來(lái)，看起來(lái)就是個(gè)面了。如果你用POVray渲染器再渲染一下可能會(huì)更好看。 Multiwfn可以把極值點(diǎn)的坐標(biāo)導(dǎo)出到pdb文件里。將此pdb文件載入到VMD里，并用適當(dāng)大小的圓球方式顯示它們，就能看到分子表面上的極值點(diǎn)位置了。 Display菜單里把Depth Cueing關(guān)掉可以解決發(fā)暗的問(wèn)題。 作圖時(shí)還有許多細(xì)碎、靈活的技巧，需要自行嘗試、摸索，才能讓圖像對(duì)于當(dāng)前的體系最美觀、清晰。 |
11樓2013-04-23 18:56:58
sobereva
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 [ Last edited by 111222000 on 2013-3-10 at 16:27 ] |
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