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shiyiwenren至尊木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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[求助]
CCDC索取的MOF的cif文件導(dǎo)入到MS中后顯示的結(jié)構(gòu)與文獻(xiàn)中的不一致
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最近向CCDC那邊索要了一個(gè)ZIF-7的cif文件，但是在導(dǎo)入MS后發(fā)現(xiàn)結(jié)構(gòu)與文獻(xiàn)中的相差很大，而且有很多不合理的地方。一開(kāi)始導(dǎo)入的時(shí)候結(jié)構(gòu)中各個(gè)原子并沒(méi)有成鍵，我用calculate bonds的功能讓其成鍵，成鍵后發(fā)現(xiàn)里面有一些水分子存在，我將這部分原子刪除后，又發(fā)現(xiàn)結(jié)構(gòu)中的苯環(huán)和咪唑有問(wèn)題，兩個(gè)苯環(huán)或咪唑或者共用其中的兩個(gè)原子，并呈一定角度，如下圖所示。向大家請(qǐng)教一些，這種從CCDC中導(dǎo)入的結(jié)構(gòu)應(yīng)該怎么處理才能時(shí)其與文獻(xiàn)報(bào)道的一致呢？ cif文件鏈接： http://good.gd/2458964.htm 圖片2.png |
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2013-03-08 10:32:15, 14.48 K
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cg陳
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