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shiyiwenren至尊木蟲 (著名寫手)
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[求助]
CCDC索取的MOF的cif文件導入到MS中后顯示的結構與文獻中的不一致
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最近向CCDC那邊索要了一個ZIF-7的cif文件,但是在導入MS后發(fā)現結構與文獻中的相差很大,而且有很多不合理的地方。一開始導入的時候結構中各個原子并沒有成鍵,我用calculate bonds的功能讓其成鍵,成鍵后發(fā)現里面有一些水分子存在,我將這部分原子刪除后,又發(fā)現結構中的苯環(huán)和咪唑有問題,兩個苯環(huán)或咪唑或者共用其中的兩個原子,并呈一定角度,如下圖所示。向大家請教一些,這種從CCDC中導入的結構應該怎么處理才能時其與文獻報道的一致呢? cif文件鏈接: http://good.gd/2458964.htm 圖片2.png |
鐵桿木蟲 (正式寫手)
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至尊木蟲 (著名寫手)
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