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[交流]
gamess 的輸出文件
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| 小妹,最近剛剛學習GAMESS,想請教各位大俠有沒有關(guān)于GAMESS的輸出文件和臨時文件的相關(guān)參考書啊,給推薦一下,還有就是我如果想看我的軌道信息需要CHK文件,怎么辦。縂AMESS怎么查看軌道? |
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GAMESS的話可以去它的官網(wǎng)上下啊。下載程序之后(我用的是Linux版)里面有幾個文檔: Section 1 - INTRO.DOC - Overview Section 2 - INPUT.DOC - Input Description Section 3 - TESTS.DOC - Input Examples Section 4 - REFS.DOC - Further Information Section 5 - PROG.DOC - Programmer's Reference Section 6 - IRON.DOC - Hardware Specifics 以上內(nèi)容是GAMESS的INTRO.DOC中的介紹。這些文件說是.DOC,其實就是文本文檔,用記事本,寫字板都可以打開。當然,官網(wǎng)上也有PDF版的。 GAMESS中沒有CHK文件,忘了高斯的那套吧。比如進行一次計算,輸入文件為test.inp (GAMESS輸入文件的擴展名為INP),你會得到一個test.dat的文件,里面包含了體系的幾何結(jié)構(gòu),基組,分子軌道($VEC)等。對于幾何構(gòu)型優(yōu)化,還有每一步的幾何構(gòu)型,還有最終的Hessian矩陣($HESS)。$VEC可以拿出來貼在輸入文件中作為初始猜測,$HESS也可以放在輸入文件中,為頻率計算提供Hessian矩陣。 GAMESS的輸出比較有意思。默認是輸出到屏幕的。想要得到輸出文件,需要重定向一下: rungms test.inp >&test.out 將輸出信息導入到test.out文件中,這個就是你要的輸出文件了?窜壍赖脑捒梢杂肕OLDEN軟件讀取test.out然后查看MO,或者用GAMESS開發(fā)組提供的MacMolPlt。這個軟件專門為GAMESS設計,可以利用輸出文件(如test.out)或者DAT文件(如test.dat)查看結(jié)果,包括幾何構(gòu)型,分子軌道,振動頻率和模式等等,也可以建模,產(chǎn)生輸入文件。和GaussianView的功能非常接近。 最后附上兩個網(wǎng)址: GAMESS官網(wǎng): http://www.msg.ameslab.gov/gamess/ MacMolPlt官網(wǎng): http://www.scl.ameslab.gov/MacMolPlt/ |
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