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就鑒別雙歧桿菌
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哪位大俠做過用16S鑒別雙歧桿菌?用細菌通用引物能做嗎?謝謝! |
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我這幾天在做16S雙歧桿菌的鑒定,剛開始跑沒條帶,后來好不容易有了,可又好多條帶,郁悶!可否幫我分析一下?謝謝!條件是: 94度 4分鐘 94度 30秒 55度 30秒 72度 2分鐘 30個循環(huán) 72度 10分鐘 梯度PCR也做了,條帶也很多,這么辦。 |
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降落PCR(touchdown PCR),一種PCR技術(shù),主要用于PCR的條件的優(yōu)化。在許多情況下引物的設(shè)計使得PCR難以進行,例如特異性不夠易錯配等。退火溫度過高會使PCR效率過低,但退火溫度過低則會使非特異擴增過多。這雖然可以通過反復(fù)嘗試來優(yōu)化,但費時費力。降落PCR提供了一個較為簡易的優(yōu)化方法。其原理大致是這樣的。首先在較高的溫度下擴增,此時雖然擴增效率低,但非特異擴增基本沒有。隨著退火溫度的降低,非特異擴增會逐步增多。但由于此時特異的擴增產(chǎn)物已經(jīng)達到一定的數(shù)量優(yōu)勢,因此會對非特異擴增產(chǎn)生強烈的競爭抑制,從而大幅提高PCR的特異性和效率。這一PCR技術(shù)已經(jīng)大量地進入醫(yī)療臨床應(yīng)用。現(xiàn)在,以高通量PCR為基礎(chǔ)的檢測方法、如人的 HLA分型 大多采用這一技術(shù)。 設(shè)計多循環(huán)反應(yīng)的程序,以使相連循環(huán)的退火溫度越來越低。由于開始時的退火溫度選擇為高于估計的Tm值,隨著循環(huán)的進行,退火溫度逐漸降到Tm值,并最終低于這個水平,用于確保第一個引物—模板雜交事件發(fā)生在最互補的反應(yīng)物之間,即那些產(chǎn)生目的擴增產(chǎn)物的反應(yīng)物之間。盡管退火溫度最終會降到非特異雜交的Tm值,但此時目的擴增產(chǎn)物已開始幾何擴增,在剩下的循環(huán)中處于超過任何滯后(非特異)PCR產(chǎn)物的地位。 說白了就是先提高退火溫度,將目的片段擴增出來,然后逐漸降低退火溫度,這樣做的好處就是能夠減少非特異性條帶的擴增。 |




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