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forgive09新蟲 (初入文壇)
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[求助]
SSR分子標(biāo)記的時(shí)候?yàn)槭裁床糠諨NA不能跑出來
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本人在做苦瓜SSR的分子標(biāo)記，但是幾次過后，總是有部分DNA的條帶不能跑出來，現(xiàn)在我用的是6%聚丙烯酰胺在跑電泳。電壓是300V，跑的時(shí)間3個(gè)小時(shí)。到底是體系沒有優(yōu)化好呢，還是其他的什么問題呢？版里誰做過SSR標(biāo)記的給我支個(gè)招，看看我做的苦瓜SSR的分子標(biāo)記問題出在哪里，給點(diǎn)參考建議，我下面該如何是好？不勝感激 20130320C11FC11R(27~47).jpg |
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rommel1941
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【答案】應(yīng)助回帖
| 恕我直言，你的問題就很含糊。一個(gè)個(gè)體出現(xiàn)多少條帶并沒有一定的，尤其是SSR這種短串聯(lián)標(biāo)記，這就是所謂個(gè)體差異。不是說每個(gè)個(gè)體都會(huì)出現(xiàn)預(yù)期的條帶。如果motif=2，片段差2個(gè)堿基在凝膠你基本分析不出來。用SSR標(biāo)記最好的檢驗(yàn)方法是熒光標(biāo)記因無，通過genescan才是分辨的最好方法，使用凝膠分析只是看個(gè)皮毛，粗略掌握以下Locus的多態(tài)性。 |
forgive09
7樓2013-03-23 14:50:05
2樓2013-03-21 11:21:19
rommel1941
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3樓2013-03-21 14:15:13
forgive09
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4樓2013-03-21 22:58:19
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