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神話米亞新蟲 (初入文壇)
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[求助]
蟲友們!請教大家關(guān)于腸道菌DNA提取的問題
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以下是我的提取過程,不吝賜教哈 1)將腸道研磨物500r/min離心5min,收集上清液,重復(fù)2次。將腸道微生物12000r/min離心10min沉淀,去上清液。加入480μL TE緩沖液,用吸管反復(fù)吹打使之重懸。 2)加入20μL 100mg/ml溶菌酶,使終濃度為4mg/mL,37°C溫育20min。 3)加入30μL 10% SDS 和5μL 20mg/mL蛋白酶K,混勻,56°C溫育40min。(期間可以輕柔振蕩幾次幫助裂解。) 4)加入100μL 5mol/LNaCl,充分混勻,再加入85μL CTAB/NaCl,混勻,65°C溫育10min。 5)等體積(720ul)苯酚/氯仿/異戊醇(25:24:1)抽提兩次,12000r/min離心5min,將上清液轉(zhuǎn)移至新EP管中。第一次抽提后,加5μL 25mg/mlRNA酶,振蕩均勻,37度水浴8min,之后進行第二次抽提。 6)加入0.6體積(450ul)異丙醇,輕輕混合直到DNA沉淀下來(冰箱靜至半小時讓DNA沉淀)12000r/min離心10min。 7)加入1mL 70%冰乙醇洗滌,(渦旋震蕩起沉淀數(shù)秒鐘)離心5min,棄上清,自然通風干燥20min,重溶于10μL的TE緩沖液中(65°C下水浴1小時重溶)。 將提取的總DNA用0.8%瓊脂糖凝膠電泳檢測。 希望大家?guī)臀铱纯从袥]有問題哈。讓我比較頭疼是RNA酶要在什么時候加比較好,因為加完要讓它起作用,又要最終除去。有考慮過在第三、四步的時候加,但是RNA酶怕蛋白酶K 和CTAB。所以就在抽提第一次后加,再在第二次抽提的時候除去。不知道可不可以?另外的問題是大家?guī)臀铱纯锤鞣N試劑加的量有沒有特別不合適的地方?》 |
分子生化實驗經(jīng)驗積累 |
銀蟲 (小有名氣)
新蟲 (初入文壇)
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