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Leliel銅蟲 (初入文壇)
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[求助]
關(guān)于SMD溶劑化模型的輸入文件格式
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各位師兄師姐好，我是一個大三藥學(xué)生，在實(shí)驗(yàn)室做一些計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)方向的東西。最近在做一個關(guān)于取代苯甲酸的一個計(jì)算，但是各種算的離譜。 最近讀到一篇文章（2012年的）提到采用了新的溶劑化模型，是SMD，在G09中有（我之前用的G03），所以對這個模型不是很熟悉，想問問有沒有對這個模型有了解的，這個SMD的輸入文件該怎么寫呢... 以下是之前我跟著老師給的example寫的輸入，其實(shí)其中有很多不是太了解（好吧其實(shí)就是不怎么了解），我在想是不是吧scrf中的PCM改成SMD就可以了呢？我看到底下有一些PCMDOC，還有一些自定義半徑的...不知道有沒有什么需要更改的。謝謝指教！當(dāng)然如果可以的話希望能告訴我有什么方法什么地方可以學(xué)到這些具體的東西也好，謝謝��！ #P MP2/6-31+G* scrf=(pcm,read,solvent=Water) geom=check guess=read scf=(maxcycl=500,nosymm,tight) int(grid=ultrafine) nosymm PCM-H -1 1 PCMDOC OFAC=0.8 RMIN=0.5 SCFVAC |
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孟娜娜
金蟲 (著名寫手)
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| http://www.gaussian.com/g_tech/g_ur/k_scrf.htm看看這個，有些溶劑是G09自帶的，比如您的溶劑水，看看網(wǎng)頁的最下面，希望對你有助 |
2樓2013-12-16 10:32:04
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