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Leliel銅蟲 (初入文壇)
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[求助]
關于SMD溶劑化模型的輸入文件格式
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各位師兄師姐好，我是一個大三藥學生，在實驗室做一些計算機輔助藥物設計方向的東西。最近在做一個關于取代苯甲酸的一個計算，但是各種算的離譜。 最近讀到一篇文章（2012年的）提到采用了新的溶劑化模型，是SMD，在G09中有（我之前用的G03），所以對這個模型不是很熟悉，想問問有沒有對這個模型有了解的，這個SMD的輸入文件該怎么寫呢... 以下是之前我跟著老師給的example寫的輸入，其實其中有很多不是太了解（好吧其實就是不怎么了解），我在想是不是吧scrf中的PCM改成SMD就可以了呢？我看到底下有一些PCMDOC，還有一些自定義半徑的...不知道有沒有什么需要更改的。謝謝指教！當然如果可以的話希望能告訴我有什么方法什么地方可以學到這些具體的東西也好，謝謝！！ #P MP2/6-31+G* scrf=(pcm,read,solvent=Water) geom=check guess=read scf=(maxcycl=500,nosymm,tight) int(grid=ultrafine) nosymm PCM-H -1 1 PCMDOC OFAC=0.8 RMIN=0.5 SCFVAC |
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孟娜娜
金蟲 (著名寫手)
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| http://www.gaussian.com/g_tech/g_ur/k_scrf.htm看看這個，有些溶劑是G09自帶的，比如您的溶劑水，看看網(wǎng)頁的最下面，希望對你有助 |
2樓2013-12-16 10:32:04
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