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qianpeng1111新蟲 (初入文壇)
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[求助]
關(guān)于SSR引物多態(tài)性的求助
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| 我是做小麥抗病基因定位的，做的是SSR引物，目前篩選出四條引物，但其中三條并不是共顯性的引物，更奇怪的的是，我定位的是顯性基因，其中兩條引物的帶型很奇怪，純和抗是一個(gè)帶型，雜合和純和感是相同一個(gè)帶型，而我平時(shí)從文獻(xiàn)里看到的一般都是共顯性表現(xiàn)的是純和抗一個(gè)帶型，純合感一個(gè)帶型，雜合是組合帶。要不就是顯性標(biāo)記，純合抗和雜合抗是一個(gè)帶型，純和感無帶啊。我表示很疑惑啊，并且我看別人篩選的共顯性的都比較多，顯性的SSR都很少，可是目前我只有一個(gè)是共顯性的，會(huì)不會(huì)最后算下來都不連鎖哦？！那不是很悲慘。。。。哎，，，，求大俠救我！ |
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
qianpeng1111: 金幣+10, ★★★★★最佳答案 2013-04-15 21:20:45
gyesang: 金幣+2, 鼓勵(lì)回帖應(yīng)助！ 2013-04-29 14:38:10
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這種奇怪的現(xiàn)象是不同基因型pcr擴(kuò)增效率差異大造成的。就是抗性基因型擴(kuò)增效率較低，在純和狀態(tài)，無效率更高的感病基因型模板競(jìng)爭(zhēng)，能正常擴(kuò)增。在雜合狀態(tài)，競(jìng)爭(zhēng)造成抗性基因型基本無擴(kuò)增，表現(xiàn)出感病純和帶型。這種標(biāo)記只能當(dāng)成感病顯性標(biāo)記。擴(kuò)增效率差異大，有可能是ssr重復(fù)次數(shù)差異太大造成，也可能是引物序列部分不保守造成的，前者基本無望改進(jìn)，后者可通過測(cè)序后重設(shè)計(jì)引物解決。至于標(biāo)記顯性還是共顯性，這與連鎖與否關(guān)系不大，只是顯性標(biāo)記在基因定位時(shí)，缺少三分之二的信息量，造成遺傳距離計(jì)算分辨率降低 [ 發(fā)自手機(jī)版 http://www.gaoyang168.com/3g ] |
2樓2013-04-13 21:27:26
qianpeng1111
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 3.5
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- 在線: 7.9小時(shí)
- 蟲號(hào): 2145829
- 注冊(cè): 2012-11-24
- 專業(yè): 作物分子育種
3樓2013-04-15 21:22:23
4樓2013-04-16 08:54:31
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