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小木蟲論壇-學術(shù)科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 第一性原理 » MS » 晶體坐標變換問題
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龍山獅崖鐵桿木蟲 (正式寫手)
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[求助]
晶體坐標變換問題
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| 有一個晶體，晶胞三個方向的晶格長度分別為a，b，c，我想將晶體的前兩個方向變一下，也就是晶格長度變?yōu)閎，a，c，請問晶體內(nèi)的各個原子坐標該如何變化？用那些軟件能辦到？謝謝！ |
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龍山獅崖
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2樓2013-05-12 13:36:46
liqizuiyang
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【答案】應助回帖
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龍山獅崖: 金幣+10, ★★★★★最佳答案, 謝謝！ 2013-05-12 20:38:32
龍山獅崖: 金幣+10, ★★★★★最佳答案, 謝謝！ 2013-05-12 20:38:32
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用線性代數(shù)里的坐標變換方法。 寫出新的基矢在舊基矢下面的轉(zhuǎn)換矩陣，然后用每個原子對應的位置矢量乘以這個矩陣。這樣雖然麻煩點，但是卻是萬能的。這個腳本可以用matlab來寫。 設(shè)原來的基矢是v1,v2,v3，新基矢是u1,u2,u3，某個原子在舊基矢下的分量表示成[v|a]，對應的新基矢下的分量是[u|a]，這個轉(zhuǎn)換關(guān)系寫成矩陣式就是[u|a] = [u|v]*[v|a]。[u|v]就是基組v在基組u下的表示矩陣。 例如v1 = 1 * u1 + 2 * u2 + 3 * u3，轉(zhuǎn)換矩陣的第一列就是transpose([1,2,3])。注意這里是列矢量而不是行矢量，轉(zhuǎn)換的時候原子坐標也是列矢量。 |
3樓2013-05-12 19:17:45
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