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請(qǐng)問(wèn)有沒(méi)有小分子數(shù)據(jù)庫(kù)可以直接下載相關(guān)的力場(chǎng)參數(shù)文件的?
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| 請(qǐng)問(wèn)有沒(méi)有小分子數(shù)據(jù)庫(kù)可以直接下載相關(guān)的力場(chǎng)參數(shù)文件的? |
amber |
木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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如果你用CHARMM力場(chǎng)的話 力場(chǎng)參數(shù)直接在這里下就行了,只和原子類(lèi)型有關(guān),和分子無(wú)關(guān) http://mackerell.umaryland.edu/CHARMM_ff_params.html 拓?fù)湮募攀侵付ǚ肿佑迷訉儆谀欠N原子類(lèi)型的文件,你可以先做成PDB,然后提交到這個(gè)網(wǎng)站上去 https://www.paramchem.org/ 他就會(huì)自動(dòng)生成小分子的拓?fù)湮募? |
金蟲(chóng) (小有名氣)
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