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cya_yanan銀蟲 (小有名氣)
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[求助]
用BALST比對相似高的序列建樹，為什么不在同一分支呢
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| 如題，測序得到幾個序列，BLAST后得到幾個相似性很高的序列，可是建樹的時候他們不在一個分支啊，怎么回事啊 ，新人啊 |
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2樓2013-05-12 09:06:36
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4樓2013-05-27 16:01:08
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5樓2013-05-27 16:06:09
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6樓2013-05-28 07:39:36
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7樓2013-11-08 15:44:13
【答案】應(yīng)助回帖
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建樹之前是需要做其他的模型檢驗的，建樹的根本是序列在進化過程中的變化，假如在一個漫長的進化過程中（可能是數(shù)百萬年乃至上億年），某一個位點的堿基由A變成G,然后再有G突變成A，而另外一個物種的的該位點始終是A，表面上著兩個序列式一樣的，那么他們的進化是不一樣的，在建數(shù)的時候不是僅僅比較序列相似性，點一點軟件這么簡單，這樣子建的樹，可信度往往很低，建樹要對序列位點選擇壓力驗證，某些位點是正向突變，反向突變還是中性突變。此外，要進行飽和性檢驗，已經(jīng)達到位點飽和的序列是不適合用來建進化樹的，所有不是所有的序列都能拿來搞進化的。 希望可以幫到你~~ |
8樓2013-11-08 18:55:56
dllchina
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9樓2013-11-09 12:26:28
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