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yida木蟲 (小有名氣)
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[求助]
分子動(dòng)力學(xué)相互作用能比較
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我想比較3個(gè)小分子與金屬表面的相互作用能,現(xiàn)在用的是同一個(gè)力場(chǎng),其余參數(shù)也都是相同的,但是經(jīng)過(guò)500ps NVT,5ns NVE 后有兩個(gè)小分子能量平衡,一個(gè)跑了2ns 多的NVE就能量過(guò)大終止了 要是能量太大的那個(gè)小分子得做其他的處理的話,其余兩個(gè)是不是也得同樣操作。磕M的話是不是也得遵循平行原則啊 |
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