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499649610金蟲 (小有名氣)
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[求助]
基因敲除 已有1人參與
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| 最近做細(xì)菌(革蘭氏陰性菌)的基因敲除,利用同源重組的方式(雙交換),請問我設(shè)計左右同源臂至少應(yīng)該多長,左右同源臂是一樣長好還是不一樣長好?求指導(dǎo)!我有設(shè)計一邊500多,一邊260的樣子,是否可行?求指導(dǎo)!還有,做敲除的注意事項能否告知。ㄎ矣玫馁|(zhì)粒是自殺性質(zhì)粒,不引入抗性基因) |
至尊木蟲 (文壇精英)
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非特異性回答,具體情況具體分析,僅供參考。 利用同源重組構(gòu)建基因敲除的基本步驟: a. 基因載體的構(gòu)建:把目的基因和與細(xì)胞內(nèi)靶基因特異片段同源的DNA 分子都重組到帶有標(biāo)記基因(如neo 基因,TK 基因等)的載體上,成為重組載體;蚯贸菫榱耸鼓骋换蚴テ渖砉δ埽砸话阍O(shè)計為替換型載體。 b.ES 細(xì)胞的獲得:現(xiàn)在基因敲除一般采用是胚胎干細(xì)胞,最常用的是鼠,而兔,豬,雞等的胚胎干細(xì)胞也有使用。常用的鼠的種系是129及其雜合體,因?yàn)檫@類小鼠具有自發(fā)突變形成畸胎瘤和畸胎肉瘤的傾向,是基因敲除的理想實(shí)驗(yàn)動物。而其他遺傳背景的胚胎干細(xì)胞系也逐漸被發(fā)展應(yīng)用。 c.同源重組:將重組載體通過一定的方式(電穿孔法或顯微注射)導(dǎo)入同源的胚胎干細(xì)胞(ES cell)中,使外源DNA與胚胎干細(xì)胞基因組中相應(yīng)部分發(fā)生同源重組,將重組載體中的DNA序列整合到內(nèi)源基因組中,從而得以表達(dá)。一般地,顯微注射命中率較高,但技術(shù)難度較大,電穿孔命中率比顯微注射低,但便于使用。 d.選擇篩選已擊中的細(xì)胞:由于基因轉(zhuǎn)移的同源重組自然發(fā)生率極低,動物的重組概率為10-2~10-5,植物的概率為10-4~10-5。因此如何從眾多細(xì)胞中篩出真正發(fā)生了同源重組的胚胎干細(xì)胞非常重要。目前常用的方法是正負(fù)篩選法(PNS法),標(biāo)記基因的特異位點(diǎn)表達(dá)法以及PCR法。其中應(yīng)用最多的是PNS法。 e.表型研究:通過觀察嵌和體小鼠的生物學(xué)形狀的變化進(jìn)而了解目的基因變化前后對小鼠的生物學(xué)形狀的改變,達(dá)到研究目的基因的目的。 f.得到純合體:由于同源重組常常發(fā)生在一對染色體上中一條染色體中,所以如果要得到穩(wěn)定遺傳的純合體基因敲除模型,需要進(jìn)行至少兩代遺傳. |
銀蟲 (初入文壇)
金蟲 (小有名氣)
金蟲 (正式寫手)
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