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Multiwfn讀取NBO的.40文件是對(duì)應(yīng)MO嗎？
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如題，manual里說(shuō)NBO的.40文件是NLMO，我聽(tīng)說(shuō)這種軌道的性質(zhì)和MO是相同的，請(qǐng)問(wèn)這種說(shuō)法是否正確？ 另外，我試著做了.40的電子密度格點(diǎn)文件，又對(duì)同一結(jié)構(gòu)(相同坐標(biāo))再次用高斯計(jì)算能量，得到MO軌道的fch文件，同樣做電子密度格點(diǎn)。兩個(gè)格點(diǎn)文件的質(zhì)量選擇相同，二者相減會(huì)得到差值，也就是說(shuō).40和MO電子密度格點(diǎn)不一樣。這是正常的嗎？ |
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這些.xx文件之間也不能相互比較計(jì)算出來(lái)的總的密度或其它實(shí)空間函數(shù) 原理上說(shuō)，PNAO/NAO/PNHO/NHO/PNBO/NBO/PNLMO/NLMO/MO這些不管用哪種類(lèi)型軌道，實(shí)空間函數(shù)（如總密度）的計(jì)算結(jié)果都是完全一致的，所以實(shí)空間函數(shù)的計(jì)算只要用MO就行了（.fch/.molden/.wfx/.wfn作為輸入文件），基于其它的軌道來(lái)計(jì)算由于結(jié)果和基于MO的完全一致，所以沒(méi)必要用它們。 而之所以我提到不要用NBO程序給出的軌道來(lái)計(jì)算（NLMO除外），一方面是因?yàn)檫@些NBO plot文件里往往沒(méi)有正確記錄或者根本沒(méi)記錄軌道占據(jù)數(shù)；另一方面是由于以某些類(lèi)型軌道為基時(shí)（如NBO），整體的密度矩陣不是對(duì)角矩陣，此時(shí)以Multiwfn目前基于MO計(jì)算密度的方式來(lái)計(jì)算NBO表達(dá)的密度結(jié)果會(huì)和實(shí)際有一定偏差。 |
9樓2013-06-16 18:57:29
sobereva
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.40是MO，.39才是NLMO（手冊(cè)寫(xiě)錯(cuò)了） NLMO和MO截然不同，前者可認(rèn)為是對(duì)后者酉變換產(chǎn)生的定域化軌道 .40和fch里的MO應(yīng)當(dāng)是一樣的，存在差值可能是微小的數(shù)值精度問(wèn)題所致，或者什么其它地方?jīng)]有完全對(duì)應(yīng)上。最好直接通過(guò)在主功能0觀(guān)看等值面來(lái)比較二者。 |
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