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zq347597638新蟲 (小有名氣)
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[求助]
關(guān)于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序Unigene
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想做基因差異表達(dá)，但是我們沒有參考序列，只能做轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，但是分析結(jié)果里面是4）Unigene功能注釋及COG分析； 5）Unigene的GO分類； 6）Unigene代謝通路分析； 7）預(yù)測(cè)編碼蛋白框（CDS）； 8）Unigene表達(dá)差異分析； 這個(gè)Unigene到底指什么意思啊？ 得出來的結(jié)果可靠嗎？ 請(qǐng)高手幫忙！ |
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 Dionysius |
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niil
金蟲 (正式寫手)
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
kx444555: 金幣+2, 鼓勵(lì)交流 2013-06-17 23:10:52
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kx444555: 金幣+2, 鼓勵(lì)交流 2013-06-17 23:10:52
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轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的原始測(cè)序包含了很多的reads，通過序列的拼接，具有重疊區(qū)的reads會(huì)被組裝成更大的片段，稱之為contig。將reads比對(duì)回Contig，通過paired-end reads能確定來自同一轉(zhuǎn)錄本的不同Contig以及這些Contig之間的距離，將這些Contig連在一起,最后得到兩端不能再延長(zhǎng)的序列，稱之為Unigene。 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)是比較可靠的，但是對(duì)篩選出的單個(gè)基因的功能進(jìn)行驗(yàn)證的時(shí)候，最好再有針對(duì)性的測(cè)序驗(yàn)證。 |
2樓2013-06-17 21:35:10
zq347597638
新蟲 (小有名氣)
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3樓2013-06-20 17:25:43
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4樓2013-11-20 16:14:13
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