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zq347597638新蟲 (小有名氣)
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[求助]
關(guān)于轉(zhuǎn)錄組測序Unigene
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想做基因差異表達(dá)，但是我們沒有參考序列，只能做轉(zhuǎn)錄組測序，但是分析結(jié)果里面是4）Unigene功能注釋及COG分析； 5）Unigene的GO分類； 6）Unigene代謝通路分析； 7）預(yù)測編碼蛋白框（CDS）； 8）Unigene表達(dá)差異分析； 這個Unigene到底指什么意思��？ 得出來的結(jié)果可靠嗎？ 請高手幫忙！ |
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 Dionysius |
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luck_cc
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4樓2013-11-20 16:14:13
niil
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【答案】應(yīng)助回帖
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轉(zhuǎn)錄組測序的原始測序包含了很多的reads，通過序列的拼接，具有重疊區(qū)的reads會被組裝成更大的片段，稱之為contig。將reads比對回Contig，通過paired-end reads能確定來自同一轉(zhuǎn)錄本的不同Contig以及這些Contig之間的距離，將這些Contig連在一起,最后得到兩端不能再延長的序列，稱之為Unigene。 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)是比較可靠的，但是對篩選出的單個基因的功能進(jìn)行驗(yàn)證的時候，最好再有針對性的測序驗(yàn)證。 |
2樓2013-06-17 21:35:10
zq347597638
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3樓2013-06-20 17:25:43
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