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multiwfn里的哪些功能可以對(duì)NBO生成的.xx文件使用？
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請(qǐng)問一下multiwfn里的哪些功能可以對(duì)NBO生成的.xx文件使用？ 上次問電子密度的事，后來發(fā)現(xiàn)-3(選擇分子片段)功能使用后，0功能顯示的軌道會(huì)變得非常奇怪。因此不敢自己隨便做了，想先系統(tǒng)地了解下哪些功能適用，謝謝！ |
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sobereva
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那篇文章我以前看過，他只是臆測而已，我并不完全贊同其觀點(diǎn)。NPA電荷高估離子性這是沒錯(cuò)的。 所謂的正交尾巴是針對(duì)單個(gè)NAO或NBO而言的，直接做軌道等值面圖，把isovalue調(diào)小了就能直接看到，你也可以選擇做平面圖或曲線圖來更精確地研究。 這篇文章http://hi.baidu.com/sobereva/item/7569d7abae9e6a258819d37e 最后一幅圖的左下角那張子圖，注意看會(huì)發(fā)現(xiàn)有一小部分C-H NBO的等值面出現(xiàn)在了鄰近的氧原子上，這就是所謂的正交尾巴。 如果目是為了看某個(gè)原子上所有NAO的正交尾巴的總分布，那么就在主功能26的功能6里把除了那個(gè)原子以外的其它原子上的NAO的占據(jù)數(shù)都設(shè)為0，然后做密度圖，就能看到由于NAO之間的正交性要求，導(dǎo)致此原子的密度分布有多少漏到了臨近原子上。但這只能定性地考察，而不要定量地討論。因?yàn)橹罢f過的原因，基于NAO、NBO之類在Multiwfn里無法得到精確的密度（但偏離不很大）。 |
klaus19877樓2013-06-29 19:51:21
sobereva
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支持NBO plot文件的初衷只是為了觀看NBO產(chǎn)生的各種軌道，而不是基于它們做分析。計(jì)算實(shí)空間函數(shù)根本沒必要用NBO plot文件。 我不知道你打算用Multiwfn對(duì)NBO產(chǎn)生的軌道做哪些分析，如果計(jì)算實(shí)空間函數(shù)，除非是基于NLMO，否則只能一次考察一個(gè)軌道的貢獻(xiàn)（比如考察某個(gè)軌道的電子密度分布），而所有軌道加和值（如總密度）是沒意義的，是和實(shí)際有偏差的。 軌道成分分功能對(duì)于各種NBO產(chǎn)生的軌道都可以做。 |
2樓2013-06-27 12:55:38
3樓2013-06-28 09:08:08
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4樓2013-06-28 15:23:19
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