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huyingdamon
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[求助]
小分子top獲得方法
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我做gromas模擬,現(xiàn)在要得到諸如甲基丙烯酸,吡啶之類小分子的top文件,該如何得到?前段時(shí)間我是通過畫出他們的分子式,得到pdb結(jié)構(gòu)然后復(fù)制到frodrg網(wǎng)站在線獲得top文件,不過這種方式得到的top文件中電荷組及電荷都不準(zhǔn),怎么解決這個(gè)問題。窟有如果就用proidrg得到的top,不做修改直接用于模擬,這樣可以嗎? 謝謝大家了 |
gromacs |
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