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nnxqwei至尊木蟲 (職業(yè)作家)
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[求助]
求助酶的Kcat 計(jì)算!
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求助Kcat 計(jì)算! 我用終濃度為100nM 純酶(分子量440KDa)對(duì)一類底物進(jìn)行動(dòng)力學(xué)測(cè)定,比活力為68U/mg, 通過(guò)雙曲線法得到底物的km值為0.2 mM, Vmax為40.22 mM/min,我用常用的公式計(jì)算酶對(duì)該底物的Kcat=Vmax/[E],結(jié)果好象不對(duì)。!搞了好長(zhǎng)時(shí)間,越來(lái)越糊涂了,請(qǐng)高手支招呀,謝謝!Kcat 應(yīng)該得多少呢,應(yīng)該如何計(jì)算呢? [ Last edited by nnxqwei on 2013-7-3 at 15:30 ] |
新蟲 (初入文壇)

木蟲 (正式寫手)
至尊木蟲 (職業(yè)作家)
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以Lineweaver-Burk雙倒數(shù)作圖最常用,測(cè)定和計(jì)算簡(jiǎn)便,也比較準(zhǔn)確。 將米-曼氏方程進(jìn)行倒數(shù)處理,得下列方程: 以1/V0為縱坐標(biāo),1/[S]為橫坐標(biāo)作圖可得一直線?v軸截距為1/Vmax,斜率為Km/Vmax,橫軸截距為-1/Km。舉例 1/V = 240.5 + 577.2 x 1/[S] , Vmax is 1/240.5 = 0.00416 , Km = 0.00416 x 577.2 = 2.40 。 ” 100nM 純酶(分子量440KDa)對(duì)一類底物進(jìn)行動(dòng)力學(xué)測(cè)定,比活力為68U/mg “,100nM*440000 (ng/L)=44000 000/1000 000 (mg/L)=44 (mg/L) ,計(jì)算得酶濃度時(shí)44mg/L 。 68U/mg*44mg/L=2992U/L=2.992u/ml ,計(jì)算得到比酶活是2.992u/ml,約3u/ml。不知道酶活是如何定義的,如果提供的信息、數(shù)據(jù)更多,更好確定。 |

至尊木蟲 (職業(yè)作家)

木蟲 (正式寫手)
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Kcat是用Vmax算出來(lái)的,而Vmax顯然是外推得到的。而米氏方程完成的條件是在測(cè)定過(guò)程中底物濃度變化不大,在底物濃度太低時(shí),由于底物的量少,變化率可能較大加上系統(tǒng)的波動(dòng)(導(dǎo)致不準(zhǔn))而底物濃度太高,速度太快,導(dǎo)致初速度測(cè)不準(zhǔn)。這樣就使得有效數(shù)據(jù)受兩端數(shù)據(jù)影響很大。所以有時(shí)推出的Vmax顯得匪夷所思,其實(shí)是很正常的。 樓主的計(jì)算沒(méi)有問(wèn)題,不過(guò)0.1uM的酶濃度可能偏高,估計(jì)測(cè)得的Vmax可能偏低。。kcat可以用s-1表示422200/60=7036.666667s-1。kcat/Km=3,5183,333.33M-1* S-1.應(yīng)該在合理范圍。 |

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