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古木天恕木蟲 (正式寫手)
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[求助]
菌懸液中不同菌的定量分析
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我有一份混菌的發(fā)酵液(植物乳桿菌,短乳桿菌,腸膜明串珠菌,干酪乳桿菌),我想在培養(yǎng)一段時間后,檢測他們含量的變化,有什么比較好的辦法?最好簡單些,成本低些。謝謝 |
鐵蟲 (初入文壇)
新蟲 (小有名氣)
鐵蟲 (初入文壇)
銅蟲 (小有名氣)
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我覺得得看你要選幾個時間點(diǎn),如果只是兩三個的話可以做16S的克隆文庫來確定各個菌株的比例,花費(fèi)主要是測序費(fèi),但操作簡單,不占用太多時間。 如果時間點(diǎn)多一些的話可能定量PCR更適合,放到文章里面也更有說服力。但你需要分別用不同的引物,得自己設(shè)計(jì)或者是查文獻(xiàn)確認(rèn)。 DGGE的話如果你以前做過那可以,沒做過的話不太推薦,因?yàn)槎坎惶,而且操作不容易?br /> T-RFLP也不錯,如果自己沒有儀器的話得送到外面公司做,你可以跟公司溝通一下,他們會給你一些建議。 |
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