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科妍

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[交流] 求高手幫忙：autodock:對(duì)接不了哈�。�

在最后一步進(jìn)行AutoDock對(duì)接時(shí)，屏幕閃圖一下就結(jié)束了，然后在輸出的命令行里總出現(xiàn)“AutoDock needs the extension of the docking parameter file to be ".dpf D:/cygwin/bin/autodock4.exe:Unsuccessful Completion” 實(shí)在費(fèi)解哈！求高手相助！！

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1樓 2013-08-13 16:45:28

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建議換用Mgtools 1.5.6，或者直接換用linux系統(tǒng)

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2樓2013-08-15 11:56:34

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2樓: Originally posted by longytu at 2013-08-15 11:56:34
建議換用Mgtools 1.5.6，或者直接換用linux系統(tǒng)

嗯，我用的就是Mgtools 1.5.6 ，現(xiàn)在問題解決了，謝謝，因?yàn)閷?duì)linux系統(tǒng)完全不熟悉，不是太想學(xué)哈，呵呵，有點(diǎn)懶。。。。。。

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3樓2013-08-16 10:20:08

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4樓2013-08-22 14:38:08

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3樓: Originally posted by 科妍 at 2013-08-16 10:20:08
嗯，我用的就是Mgtools 1.5.6 ，現(xiàn)在問題解決了，謝謝，因?yàn)閷?duì)linux系統(tǒng)完全不熟悉，不是太想學(xué)哈，呵呵，有點(diǎn)懶。。。。。。...

你好，我也遇到這個(gè)問題，請(qǐng)問你是怎么解決的。

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5樓2013-09-24 16:57:46

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6樓2013-09-24 20:05:46

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5樓: Originally posted by heyun1990 at 2013-09-24 16:57:46
你好，我也遇到這個(gè)問題，請(qǐng)問你是怎么解決的。...

我當(dāng)初是文件保存途徑出了問題，文件途徑里不能包含任何漢語，文件名也要符合autodock的標(biāo)準(zhǔn)

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7樓2013-09-30 15:38:11

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6樓: Originally posted by longytu at 2013-09-24 20:05:46
沒有生成dpf文件把

生成了，可能就是因?yàn)榍懊娴膯栴}吧！現(xiàn)在又有新的問題了，呵呵，想設(shè)置一些柔性殘基的對(duì)接，但是總跑不成功�。�

“記得這個(gè)文件中一定要有以下一行：
map hsg1_rigid.A.map # atom-specific affinity map

否則后面會(huì)報(bào)錯(cuò)的說沒有A.map生成（這跟CA－CB間的鍵沒有關(guān)系的）”

看見有PPT教程里寫了上面這段話，可是沒有map hsg1_rigid.A.map # atom-specific affinity map ，且確實(shí)報(bào)錯(cuò)說“sorry，I can't find or open hsg1_rigid.A ”怎么添加�。縀dit GPF里面雖然可以修改（通過read 和write 鍵）但是修改后又會(huì)有新的錯(cuò)誤，譬如 not enough map keywords found 等等，
不知閣下有否高招��！

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8樓2013-09-30 15:40:58

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ericzhu94515

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你怎么解決的啊

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9樓2016-02-05 00:37:03

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