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lifeutopia銅蟲 (初入文壇)
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[求助]
請教擬南芥基因組重測序問題
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| 最近計劃進行一份突變體樣品的擬南芥基因組重測序，不知是否有XDJM做過類似工作，需要準備多少個單株的樣品？測序深度是多少？測序周期？萬分感謝！ |
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bired
木蟲 (著名寫手)
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2樓2013-08-21 22:05:15
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3樓2013-10-01 10:56:24
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4樓2013-10-01 10:56:33
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擬南芥（Arabidopsis thaliana）是一種十字花科植物，在分子遺傳學(xué)、植物學(xué)以及農(nóng)業(yè)科學(xué)的研究中發(fā)揮了重要的作用，是重要的模式生物，種群間有不同的遺傳差異。 Patterns of population epigenomic diversity.中 研究人員從北半球各地收集了基因型不同的野生擬南芥，進行了詳細的群體水平分析。他們對217株植物進行了全基因組DNA測序，其中152株進行了全基因組甲基化圖譜分析，144株進行了基因轉(zhuǎn)錄圖譜分析。 不知現(xiàn)在的Pacbio測序平臺是否可以在擬南芥研究方面有所應(yīng)用 |
5樓2014-01-19 10:54:43
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