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lifeutopia銅蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
請(qǐng)教擬南芥基因組重測(cè)序問(wèn)題
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| 最近計(jì)劃進(jìn)行一份突變體樣品的擬南芥基因組重測(cè)序，不知是否有XDJM做過(guò)類似工作，需要準(zhǔn)備多少個(gè)單株的樣品？測(cè)序深度是多少？測(cè)序周期？萬(wàn)分感謝！ |
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bired
木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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- 蟲(chóng)號(hào): 180478
- 注冊(cè): 2006-02-09
- 專業(yè): 作物分子育種
2樓2013-08-21 22:05:15
gyesang: 屏蔽內(nèi)容, 違規(guī)存檔, 廣告！ 2013-10-01 17:05:49
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3樓2013-10-01 10:56:24
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4樓2013-10-01 10:56:33
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擬南芥（Arabidopsis thaliana）是一種十字花科植物，在分子遺傳學(xué)、植物學(xué)以及農(nóng)業(yè)科學(xué)的研究中發(fā)揮了重要的作用，是重要的模式生物，種群間有不同的遺傳差異。 Patterns of population epigenomic diversity.中 研究人員從北半球各地收集了基因型不同的野生擬南芥，進(jìn)行了詳細(xì)的群體水平分析。他們對(duì)217株植物進(jìn)行了全基因組DNA測(cè)序，其中152株進(jìn)行了全基因組甲基化圖譜分析，144株進(jìn)行了基因轉(zhuǎn)錄圖譜分析。 不知現(xiàn)在的Pacbio測(cè)序平臺(tái)是否可以在擬南芥研究方面有所應(yīng)用 |
5樓2014-01-19 10:54:43
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