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[求助]
求助--肝微粒體孵育實驗
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各位蟲友,大家好,我最近在做肝微粒體孵育實驗 但是沒有反應, 我的反應體系是:肝微粒體 + 藥 + NADPH + Mgcl2 + 緩沖液 → 共1ml , 先將 肝微粒體 + 藥 + Mgcl2 + 緩沖液37℃預孵育5min,NADPH 37℃預孵育5min 然后加到一塊,于5、10、20、30、60、90、120min取100ul加100ul冰冷的甲醇溶液并放入-20℃冰箱中終止反應。 肝微粒體是直接買的,終濃度為1mg/ml。 NADPH四鈉鹽買的是羅氏的,用水配后分裝小瓶,-80度冷凍,隨用隨拿,反應終濃度1mmol /L 。藥物先取了個中間值試試,是600 umol/L,還有一個終濃度5mmol/L的Mgcl2。肝微粒體和NADPH應該都沒有什么問題啊 但是卻沒什么反應 這是怎么回事呢 難道不該用NADPH或者是用水配不行?還是很說我的濃度有問題呢,我的緩沖液是ph7.4的磷酸鉀緩沖液, 望各位蟲友不吝賜教!金幣奉送! [ Last edited by 1949stone on 2013-8-27 at 07:55 ] |
分子生化實驗經(jīng)驗積累 |
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要做肝微粒體實驗,首先需要搞清楚該藥物是經(jīng)由何種酶代謝的,是I相反應的CYP酶或羧酸酯酶 ,還是說II相反應的結合酶UGT酶,因為肝微粒體中主要是I相的CYP酶和羧酸酯酶和II相的UGT酶,像其他II相酶如GST等在肝微粒體中是沒有的。 確定了參與藥物代謝酶后才能考慮你要采用的酶源使用microsome,cytosol或是S9 藥物沒被代謝原因很多,你用的是底物消除還是代謝產(chǎn)物生成,產(chǎn)物生成的話是不是因為你所用的儀器靈敏度未達到所致,可以采用高靈敏度的檢測儀器,如LC-MS/MS等,底物消除的話會不會是因為底物消除的太少,此時可以適當提高酶濃度試一下。 還有你底物的終濃度是600μmol/L嗎?有可能是該底物濃度過高,將參與其代謝的酶的活性抑制掉了 NADPH一般是現(xiàn)配現(xiàn)用,每次稱粉末,一般是用你的緩沖鹽溶液溶解,不建議直接配好分裝,因為凍融對其活性也會有影響~ 綜上,還主要是從你的檢測靈敏度,藥物底物濃度,NADPH配制入手,逐個排除,希望你實驗早日有結果~ |
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以下是我最終配置,希望您能看一下有哪里不對需要改正的,小妹初學,實屬菜鳥啊,忘提出寶貴意見: 1) 0.1mol/L 磷酸鉀緩沖溶液(PH 7.4) 配置:1mol/L的K2HPO4 取17.418 mg雙蒸水定容至100ml 取80.2ml 1mol/L的KH2PO4 取13.609 mg雙蒸水定容至100ml 取19.8ml 二者混合后用雙蒸水稀釋至1000ml,調(diào)ph至7.4。 即為0.1mol/L的磷酸鉀緩沖溶液 2) 1mg/ml大鼠肝微粒體 原裝:10mg/ml 即1mg/100ul 收到分裝后立即將其放入到-80℃冰箱中,隨用隨拿,每次100ul 肝微粒體的復溶:放入4℃解凍,解凍后混合均勻即可,使用前保持低溫儲存。 3) 1mmol /L NADPH 原粉末25mg 分子量是833.4 用磷酸鉀緩沖液配 1mmol /L = 0.8334 mg/ ml,所以將0.8334ⅹ5=4.167mg加入1ml磷酸鉀緩沖液中,取200ul 即每200ul含0.8334mg,最后再使反應體系體積為1ml,即是(終濃度為1mmol /L NADPH) 4) 5mmol/L Mgcl2 5mmol/L = 20.3mg定容至100ml ,即2.03mg定容至1ml 取100ul 5) 5umol/L – 500umol/L 底物 用PH 7.4磷酸鉀緩沖液配置 500 umol/L = 51.2 mg/L = 5.12mg/ml 即5.12mg定容1ml中取100ul 100 umol/L = 10.24 mg/L = 1.024mg/ml 取500 umol/L的底物100ul 稀釋到500ul 50 umol/L = 5.12mg/L 取500 umol/L的底物 10ul 稀釋到100ul 5 umol/L = 0.512 mg/L = 5.12mg/100ml 取50 umol/L的底物20ul 稀釋到200ul 孵育體系為1ml →加入100ul的肝微粒體(終濃度為1mg/ml) →加入200ul 5 umol/L p-II (終濃度為5 umol/L) 加入100ul 50 umol/L p-II (終濃度為50umol/L) 加入500ul 100 umol/L p-II (終濃度為100 umol/L) 加入100ul 500 umol/L p-II (終濃度為500 umol/L) →加入200ul的NADPH (終濃度為1mmol /L) →加入100ul的Mgcl2 (終濃度為5mmol/L) 依據(jù)底物濃度共分四組,最后每組都用磷酸鉀緩沖液補齊到1ml |
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以下是我最終配置,希望您能看一下有哪里不對需要改正的,小妹初學,實屬菜鳥啊,忘提出寶貴意見: 1) 0.1mol/L 磷酸鉀緩沖溶液(PH 7.4) 配置:1mol/L的K2HPO4 取17.418 mg雙蒸水定容至100ml 取80.2ml 1mol/L的KH2PO4 取13.609 mg雙蒸水定容至100ml 取19.8ml 二者混合后用雙蒸水稀釋至1000ml,調(diào)ph至7.4。 即為0.1mol/L的磷酸鉀緩沖溶液 2) 1mg/ml大鼠肝微粒體 原裝:10mg/ml 即1mg/100ul 收到分裝后立即將其放入到-80℃冰箱中,隨用隨拿,每次100ul 肝微粒體的復溶:放入4℃解凍,解凍后混合均勻即可,使用前保持低溫儲存。 3) 1mmol /L NADPH 原粉末25mg 分子量是833.4 用磷酸鉀緩沖液配 1mmol /L = 0.8334 mg/ ml,所以將0.8334ⅹ5=4.167mg加入1ml磷酸鉀緩沖液中,取200ul 即每200ul含0.8334mg,最后再使反應體系體積為1ml,即是(終濃度為1mmol /L NADPH) 4) 5mmol/L Mgcl2 5mmol/L = 20.3mg定容至100ml ,即2.03mg定容至1ml 取100ul 5) 5umol/L – 500umol/L 底物 用PH 7.4磷酸鉀緩沖液配置 500 umol/L = 51.2 mg/L = 5.12mg/ml 即5.12mg定容1ml中取100ul 100 umol/L = 10.24 mg/L = 1.024mg/ml 取500 umol/L的底物100ul 稀釋到500ul 50 umol/L = 5.12mg/L 取500 umol/L的底物 10ul 稀釋到100ul 5 umol/L = 0.512 mg/L = 5.12mg/100ml 取50 umol/L的底物20ul 稀釋到200ul 孵育體系為1ml →加入100ul的肝微粒體(終濃度為1mg/ml) →加入200ul 5 umol/L p-II (終濃度為5 umol/L) 加入100ul 50 umol/L p-II (終濃度為50umol/L) 加入500ul 100 umol/L p-II (終濃度為100 umol/L) 加入100ul 500 umol/L p-II (終濃度為500 umol/L) →加入200ul的NADPH (終濃度為1mmol /L) →加入100ul的Mgcl2 (終濃度為5mmol/L) 依據(jù)底物濃度共分四組,最后每組都用磷酸鉀緩沖液補齊到1ml |
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額,對的我覺得底物終濃度600μmol/L是有點太高了,因為有的藥物在濃度太高時同時也會是參與其反應酶的抑制劑的,建議你降低濃度,一般在不好確定底物濃度時1μM不失為一個好的選擇。 還有一個關鍵的問題,你的底物是用什么溶劑配的,如果是有機溶劑的話,一定注意有機溶劑在你孵育體系中的總體積不超過孵育體積的1%,也就是說你1ml的孵育體系,底物頂多加到10μl NADPH一般終濃度1mM足夠了, 靈敏度的話如果在液相上可以看到,質(zhì)譜上應該靈敏度是不存在問題的 ~你是沒有代謝產(chǎn)物標準品的嗎,那你要怎么確定代謝產(chǎn)物的MS條件呢,是直接找多余的離子碎片? 希望問題解決了可以告訴我一聲~ |
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