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阡陌蔓木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
分子動(dòng)力學(xué)軟件的選擇？
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9樓2013-09-29 22:00:05
【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
阡陌蔓: 金幣+10, ★★★很有幫助 2013-09-28 16:09:09
阡陌蔓: 金幣+10, ★★★★★最佳答案 2013-09-30 21:59:39
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是不是中石油的項(xiàng)目��？ 我了解的NAMD 和gromacs 以及l(fā)ammps 都可以實(shí)現(xiàn)“孔隙中水的流動(dòng)和脫附”，關(guān)鍵的問(wèn)題是，你所說(shuō)的大分子的力場(chǎng)，你如何選擇？ |
2樓2013-09-28 14:08:24
5樓2013-09-28 19:49:05
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1. 您好，請(qǐng)問(wèn)NAMD 和gromacs 以及l(fā)ammps 這三個(gè)軟件，哪個(gè)軟件對(duì)力場(chǎng)的兼容性最好？也就是說(shuō)哪個(gè)軟件可以比較自由地使用自定義的力場(chǎng)參數(shù)？我知道gmx好像都是使用幾種常用的力場(chǎng)，對(duì)自定義的力場(chǎng)兼容性并不好，不知道我的理解有沒(méi)有偏差。 2. 我現(xiàn)在也是剛剛?cè)腴T(mén)動(dòng)力學(xué)，主要做MOFs對(duì)氣體VOCs的吸附，擴(kuò)散，MSD，RDF等，這樣的體系哪個(gè)動(dòng)力學(xué)軟件比較合適呢？請(qǐng)版主推薦，謝謝！ |
6樓2013-09-29 09:15:09
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