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lmingshu新蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
自定義溶劑參數(shù)
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| 我的溶劑在高斯自帶的里面沒(méi)有，我怎么寫輸入文件呢？需要自定義的參數(shù)都有哪些呢？萬(wàn)分感謝，急求�。�！我用的是PCM模型，我知道的有：需要輸入介電常數(shù)的值，還有什么呢？ |
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hairan
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【答案】應(yīng)助回帖
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根據(jù)我的理解，generic是自定義的意思。 每種溶劑的定義方式是不一樣的。 如果你的確要經(jīng)常用到溶劑效應(yīng)，請(qǐng)仔細(xì)閱讀Gaussian09關(guān)于scrf關(guān)鍵詞的使用。 http://www.gaussian.com/g_tech/g_ur/k_scrf.htm 比如，使用smd模型你就需要定義如下內(nèi)容： index of refraction Abraham's hydrogen bond acidity Abraham's hydrogen bond basicity surface tension dielectric constant aromaticity electronegative halogenicity 相應(yīng)的在Route部分 scrf=(SMD,solvent=generic,read) 文件結(jié)尾 SolventName=my_custom_solvent EpsInf=X HBondAcidity=X HBondBasicity=X SurfaceTensionAtInterface=X Eps=X CarbonAromaticity=X ElectronegativeHalogenicity=X 其中X是這些性質(zhì)的實(shí)驗(yàn)值。 |
7樓2013-11-12 21:38:07
hairan
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除了介電常數(shù)還有一個(gè)稱為動(dòng)態(tài)或頻率依賴的介電常數(shù) 你可以按照如下方式定義： scrf=(pcm,solvent=generic,read) 在文件結(jié)尾給出 SolventName=my_custom_solvent 這個(gè)你可以隨便起一個(gè)名字 EpsInf=X 這個(gè)是頻率依賴的介電常數(shù)，數(shù)值是折射率的平方。 Eps=X 這個(gè)是介電常數(shù) Gaussian公司官方的Clemente博士說(shuō)：“如果是基態(tài)計(jì)算，只需要Eps，如果是激發(fā)態(tài)計(jì)算，兩個(gè)都需要”。 不過(guò)我沒(méi)有嘗試過(guò)，你可以試試看。 相關(guān)解釋的原文如下： If you use IEF-PCM or C-PCM models in G09, only two solvent descriptors are used, the dielectric constant (EPS) and the dynamic, or frequency-dependent, dielectric constant (EPSINF, which is the square of the refraction index). Only the first (EPS) of the two is needed for SCF ground state calculations, but both are needed (EPS and EPSINF) if doing an excited state calculation, computing frequency-dependent properties, or doing post-SCF calculations. So, one would use "SCRF=READ" and then add "EPS=XXX" in a separate section of the input file. |
2樓2013-11-11 23:27:37
lmingshu
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3樓2013-11-12 09:35:03
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4樓2013-11-12 15:15:45
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5樓2013-11-12 15:47:50
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6樓2013-11-12 16:49:05
【答案】應(yīng)助回帖
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1.generic是自定義的意思,只要你是建立新的溶劑模型(高斯里沒(méi)有的),就需要用solvent=generic,然后在末尾設(shè)置你想要采用的溶劑的參數(shù),換做其他溶劑的話,solvent=generic不需要改變,而是在后面的參數(shù)設(shè)置改變以示區(qū)別. 2.在末尾設(shè)置參數(shù)一般同時(shí)包括三個(gè)(以甲醇為例): eps=32.63 (必須輸入的項(xiàng)) epsinf=1.758 (近似等于折射率的平方,一般對(duì)于基態(tài)的計(jì)算可以不用此項(xiàng)) RSolv=3.05 (用volume計(jì)算后得到，單位為埃） （最后空一行，結(jié)束） |
8樓2013-11-13 09:05:17
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9樓2013-11-13 15:08:41
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10樓2013-11-13 15:11:24
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