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cuicui2397新蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
vasp中，結(jié)構(gòu)參數(shù)優(yōu)化時(shí)，出現(xiàn)錯(cuò)誤，求助！謝謝！
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侯老師的vasp教程中，針對(duì)復(fù)雜情況的結(jié)構(gòu)參數(shù)優(yōu)化出現(xiàn)問(wèn)題，求助！ 復(fù)雜的情況,以六角結(jié)構(gòu)Mg的晶格常數(shù)為例 1.先進(jìn)行一次體積保持不變的粒子馳豫的計(jì)算（ISIF=5） 2再把優(yōu)化得到的CONTCAR拷貝成POSCAR，進(jìn)行一次靜態(tài)的計(jì)算 3對(duì)a的值取10個(gè)左右的點(diǎn)，每個(gè)點(diǎn)重復(fù)上面兩步，得到靜態(tài)計(jì)算下volume-Etot的關(guān)系。 這三部的腳步可以通過(guò)以下腳本run_cell來(lái)進(jìn)行，內(nèi)容如下： #!/bin/sh rm WAVECAR for i in 5.20 5.23 5.26 5.29 5.32 5.35 5.38 5.41 5.44 5.47 do cat > POSCAR << ! ureadopef $i 0 -1 0 0.8660254 0.5 0 0 0 1.6230530 2 Direct 0.666666667 0.333333333 0.75 0.333333333 0.666666667 0.25 ! cp INCAR.relax INCAR echo "a=$i angestrom"; mpiexec -np 8 vasp cp CONTCAR POSCAR cp INCAR.static INCAR echo "a= $i angstrom ";mpiexec -np 8 vasp E=`grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f \n", $5}'` V=`grep "volume" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.4f \n", $5}'` echo $V $E >>EtVo.dat done 4.采用狀態(tài)方程擬合得到的平衡態(tài)下的體積，體彈性模量。 5.在該體積下，重復(fù)上面第2步和第3步，得到平衡狀態(tài)下的其他晶胞參數(shù)。這一步也就是：在的到了E(V)曲線后，通過(guò)狀態(tài)方程擬合得到平衡狀態(tài)下的體積，計(jì)算出上面腳本中的變量$i的值，并改變$i的循環(huán)值，再運(yùn)行run_cell計(jì)算一次，得到其他的結(jié)構(gòu)參數(shù)c和位置u。 我的問(wèn)題是：在執(zhí)行sh run.cell命令時(shí)，出現(xiàn)錯(cuò)誤提示是這樣的： run_cell: line 15: syntax error near unexpected token `newline' run_cell: line 15: `!' 請(qǐng)問(wèn)這是什么錯(cuò)誤�。恐x謝！我改了改！附近的內(nèi)容，還是不行。 |
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cuicui2397
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