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zhglxjt銀蟲 (初入文壇)
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[求助]
關(guān)于QSAR建模過程中分子結(jié)構(gòu)優(yōu)化方面的疑問 已有1人參與
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我正在進(jìn)行定量構(gòu)效關(guān)系(QSAR)建模方法的研究,主要是進(jìn)行算法方面的改進(jìn)與應(yīng)用,需要一些標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)集進(jìn)行驗證,但是目前只能獲取一些數(shù)據(jù)集的分子結(jié)構(gòu)式或結(jié)構(gòu)圖,需要自己利用相關(guān)軟件(ISIS Draw 等)畫出分子結(jié)構(gòu)圖,然后利用HyperChem軟件對分子結(jié)構(gòu)優(yōu)化,最后產(chǎn)生分子結(jié)構(gòu)描述符。由于我才接觸定量構(gòu)效關(guān)系不久,許多地方不是太了解,前期主要是通過查閱文獻(xiàn),從文獻(xiàn)中查找相關(guān)方法,目前很多文獻(xiàn)里提到了用HyperChem軟件對分子結(jié)構(gòu)進(jìn)行優(yōu)化,但是其中有幾段對分子結(jié)構(gòu)優(yōu)化的描述不是很理解,如下: 1. All calculations were carried out at restricted Hartree Fock level with no configuration interaction (所有的計算都是在限制性的Hartree-Fock方程的基礎(chǔ)上完成的,沒有考慮組態(tài)相互作用) 請熟悉QSAR的大牛能夠幫忙解答,不甚感激~ |

銀蟲 (初入文壇)

金蟲 (著名寫手)

金蟲 (著名寫手)
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1.是。計算三維描述符時要進(jìn)行分子結(jié)構(gòu)優(yōu)化。 2. 不同的物質(zhì)分子所包含的原子數(shù)量與種類不同,所選擇的結(jié)構(gòu)優(yōu)化方法就不一樣。精確的方法得到的結(jié)果準(zhǔn)確,但需要的計算機(jī)配置高、計算時間長,有時候要根據(jù)自己的分子特點(diǎn)選擇簡化的方法,只要方法得當(dāng),也能得到較好的結(jié)果。 |

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