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北京石油化工學(xué)院2026年研究生招生接收調(diào)劑公告

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qujinfeng

金蟲 (小有名氣)

應(yīng)助: 4 (幼兒園)
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蟲號(hào): 1396671
注冊: 2011-09-09
專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)

[求助] lammps弛豫過程

大家好，最近才知道對一個(gè)體系在動(dòng)力學(xué)模擬之前是應(yīng)該用npt進(jìn)行一次弛豫，也就是說我原本在ms建立的模型鍵長都是實(shí)驗(yàn)的理想鍵長，而在動(dòng)力學(xué)模擬的時(shí)候由于我用的勢函數(shù)發(fā)生了變化，不同的勢函數(shù)體系中鍵長也是不一樣的，所以還要npt還弛豫，這樣的話我就遇到一個(gè)問題，npt弛豫過后模擬盒子的大小都變化了，我需要把弛豫過后的結(jié)構(gòu)再一次轉(zhuǎn)化成data文件，然后接著進(jìn)行我所需要的性質(zhì)的計(jì)算模擬，就是這個(gè)再次轉(zhuǎn)換data文件我不知道怎么轉(zhuǎn)換，在npt弛豫的過程中輸出什么樣的文件更容易轉(zhuǎn)換？具體的轉(zhuǎn)換過程是怎么樣的？請大家?guī)蛶兔ρ�，不甚感激…�?

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1樓 2013-11-22 19:13:06

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

lsloneil

專家顧問 (正式寫手)

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專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
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【答案】應(yīng)助回帖

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月只藍(lán): 金幣+2, 感謝指導(dǎo)！ 2013-11-23 09:52:38
qujinfeng: 金幣+10, ★★★很有幫助 2013-12-02 15:50:13

Use 'write_data' command
http://lammps.sandia.gov/doc/write_data.html

Or you may convert your restart file to data file using 'restart2data'

http://lammps.sandia.gov/doc/Section_tools.html#restart

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回復(fù)此樓

2樓2013-11-23 01:31:02

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