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在blast里,如何與最相近的cultured菌株16S rRNA基因信息比對
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| 大家一定碰到過這種情況, 有時(shí)候想要和cultured 16S rRNA進(jìn)行比對,可是系統(tǒng)給出的都是uncultured clones,請問如何在blast里設(shè)置,能與序列相似度較大的cultured 細(xì)菌基因進(jìn)行比對. 謝謝. |
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2樓2013-11-25 10:30:22
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10樓2013-12-04 09:41:59
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http://rdp.cme.msu.edu/seqmatch/seqmatch_intro.jsp http://www.arb-silva.de/ 你說的這個(gè)問題我也遇到了，正在研究這兩個(gè)網(wǎng)站，一個(gè)是數(shù)據(jù)庫，一個(gè)是做進(jìn)化樹的 |
3樓2013-11-25 20:02:37
kiruwa
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