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kiruwa專(zhuān)家顧問(wèn) (職業(yè)作家)
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[求助]
在blast里,如何與最相近的cultured菌株16S rRNA基因信息比對(duì)
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| 大家一定碰到過(guò)這種情況, 有時(shí)候想要和cultured 16S rRNA進(jìn)行比對(duì),可是系統(tǒng)給出的都是uncultured clones,請(qǐng)問(wèn)如何在blast里設(shè)置,能與序列相似度較大的cultured 細(xì)菌基因進(jìn)行比對(duì). 謝謝. |
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kiruwa: 金幣+2 2013-11-30 09:37:10
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http://rdp.cme.msu.edu/seqmatch/seqmatch_intro.jsp http://www.arb-silva.de/ 你說(shuō)的這個(gè)問(wèn)題我也遇到了，正在研究這兩個(gè)網(wǎng)站，一個(gè)是數(shù)據(jù)庫(kù)，一個(gè)是做進(jìn)化樹(shù)的 |
3樓2013-11-25 20:02:37
kiruwa
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4樓2013-11-25 21:20:26
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