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danyzj01銀蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
用PCR擴(kuò)增后的DNA如何測(cè)序？不能直接用PCR就知道是什么菌種之類(lèi)的吧？
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| 用PCR擴(kuò)增后的DNA如何測(cè)序？不能直接用PCR就知道是什么菌種之類(lèi)的吧？ |
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cheng_xiao
木蟲(chóng) (小有名氣)
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2樓2012-04-22 16:12:37
lxj341401
至尊木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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【答案】應(yīng)助回帖
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西瓜: 金幣+4, 應(yīng)助指數(shù)+1, 專(zhuān)家考核, 專(zhuān)家就是專(zhuān)家！ 2012-04-22 19:17:44
西瓜: 金幣+4, 應(yīng)助指數(shù)+1, 專(zhuān)家考核, 專(zhuān)家就是專(zhuān)家！ 2012-04-22 19:17:44
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用PCR擴(kuò)增后的DNA一是可以直接送測(cè)序公司測(cè)序，但如果PCR不純就測(cè)不出來(lái)，二是先連接到T載體上，轉(zhuǎn)化驗(yàn)證后送菌測(cè)序。 雖然發(fā)展了不少DNA指紋技術(shù)，并且很多都和PCR有關(guān)，但通過(guò)一個(gè)PCR直接判定是什么菌現(xiàn)在還基本做不到。 |
3樓2012-04-22 16:43:51
chaovt714
金蟲(chóng) (小有名氣)
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
amisking: 金幣+2, 鼓勵(lì)幫助解答，歡迎繼續(xù)交流。 2012-04-22 20:52:00
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
amisking: 金幣+2, 鼓勵(lì)幫助解答，歡迎繼續(xù)交流。 2012-04-22 20:52:00
| 我們做菌種鑒定在16S rRNA基因同源性分析這一步中，先用通用引物擴(kuò)增出16S rDNA，這一過(guò)程最好都在無(wú)菌條件下操作，之后將PCR產(chǎn)物進(jìn)行純化，附帶上適量的你所用的引物，送英俊或生工進(jìn)行測(cè)序，再將測(cè)得的序列在NCBI中進(jìn)行Blast，即可知道你的菌種與哪類(lèi)細(xì)菌親源關(guān)系最近了~~~ |
4樓2012-04-22 20:32:04
danyzj01
銀蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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5樓2012-04-22 22:07:48
6樓2012-04-26 20:03:45
fishhuying
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7樓2018-03-13 22:45:06
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