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細菌基因組分析——COGs如何分類？
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最近在做一個細菌的基因組分析，里面需要對預測的蛋白做COGs分類。 上網查了下，主要是在NCBI上做的。 據說下了數據庫之后本地blast可以做到批量處理 所以去FTP下了數據庫，下了localblast程序，可是完全不知道如何下手啊。 求生信大神來個深入淺出的教程。 還有以前帖子上寫的單獨蛋白的COG分類（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/COG/old/xognitor.html）已經被NCBI關了。 在新的NCBI COG頁面上完全不提供單個比對，so該如何做單個比對呢？ 跪謝啊�。� ps：我只用localblast 做過基因序列的批量處理，是網上查了代碼，用perl做了個腳本做的。 |
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nanhu1984
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2樓2014-01-03 22:56:52
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