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[求助] SIESTA初安裝，TEST出現(xiàn)問題

裝上SIESTA3.1
進(jìn)入TEST h2o文件夾
make
出現(xiàn)以下錯(cuò)誤：
[root@localhost h2o]# ls
h2o.fdf h2o.pseudos makefile siesta work
[root@localhost h2o]# make
>>>> Running h2o test...
==> Copying pseudopotential file for H...
==> Copying pseudopotential file for O...
==> Running SIESTA as ../../../siesta
/bin/sh: ../../../siesta: No such file or directory
make: *** [completed_work] Error 127

請教大家，這是什么原因？

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1樓 2013-11-28 16:44:20

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印象中3.1不是直接make，而是先要configure，貌似是在src的文件夾。

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2樓2013-11-28 18:03:03

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2樓: Originally posted by 卡開發(fā)發(fā) at 2013-11-28 18:03:03
印象中3.1不是直接make，而是先要configure，貌似是在src的文件夾。

謝謝回復(fù)，如何configure,可以說詳細(xì)點(diǎn)嗎？我初學(xué)這個(gè)，按照說明書上做的。

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3樓2013-11-29 17:36:06

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cyxlcd(ben_ladeng代發(fā)): 金幣+6, 代樓主發(fā)放金幣 2013-12-06 08:52:35

首先進(jìn)入siesta的目錄，cd ~/siesta

進(jìn)入Src，cd Src

運(yùn)行./configure，此時(shí)生成了arch.make

然后根據(jù)你的環(huán)境變量進(jìn)行修改即可。vi arch.make

最后直接make就行了。

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4樓2013-11-29 23:40:12

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3樓: Originally posted by cyxlcd at 2013-11-29 17:36:06
謝謝回復(fù)，如何configure,可以說詳細(xì)點(diǎn)嗎？我初學(xué)這個(gè)，按照說明書上做的。...

寫錯(cuò)了，應(yīng)該是先進(jìn)入siesta/obj，然后../src/configure之后，修改arch.make，再make

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5樓2013-11-30 00:04:10

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3樓: Originally posted by cyxlcd at 2013-11-29 17:36:06
謝謝回復(fù)，如何configure,可以說詳細(xì)點(diǎn)嗎？我初學(xué)這個(gè)，按照說明書上做的。...

你可以詳細(xì)看看/siesta/obj下面的README已經(jīng)寫的很清楚了

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6樓2013-11-30 00:06:46

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3樓: Originally posted by cyxlcd at 2013-11-29 17:36:06
謝謝回復(fù)，如何configure,可以說詳細(xì)點(diǎn)嗎？我初學(xué)這個(gè)，按照說明書上做的。...

唉，太久不弄有點(diǎn)忘了，剛剛我自己重新編譯了一下。我就再寫一遍，上面的就別看了。
先是進(jìn)入cd ~/siesta/obj
執(zhí)行../Src/obj_setup.sh
執(zhí)行../Src/configure
修改arch.make如數(shù)學(xué)庫、MPI等
最后make

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7樓2013-11-30 00:14:50

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7樓: Originally posted by 卡開發(fā)發(fā) at 2013-11-30 00:14:50
唉，太久不弄有點(diǎn)忘了，剛剛我自己重新編譯了一下。我就再寫一遍，上面的就別看了。
先是進(jìn)入cd ~/siesta/obj
執(zhí)行../Src/obj_setup.sh
執(zhí)行../Src/configure
修改arch.make如數(shù)學(xué)庫、MPI等
最后make...

多謝你的詳細(xì)回復(fù)，我之前是按照說明書上的的編譯安裝過：
../Src/obj_setup.sh
得到arch.make
make
然后出現(xiàn)了問題。
我看了你的回復(fù)，又按你的方法做了一遍，即：“先是進(jìn)入cd ~/siesta/obj
執(zhí)行../Src/obj_setup.sh
執(zhí)行../Src/configure
最后make”然后回到test h2o文件夾中，仍然出現(xiàn)一樣的問題。
我想是不是因?yàn)槲覜]有修改arch.make文件？我現(xiàn)在只是初步安裝，還沒有涉及并行運(yùn)算，所以我就沒有更改這個(gè)文件。
請問你：只需串行的安裝，需要如何修改arch.make？
非常感謝你的幫忙！

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8樓2013-12-04 11:22:21

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8樓: Originally posted by cyxlcd at 2013-12-04 11:22:21
多謝你的詳細(xì)回復(fù)，我之前是按照說明書上的的編譯安裝過：
../Src/obj_setup.sh
得到arch.make
make
然后出現(xiàn)了問題。
我看了你的回復(fù)，又按你的方法做了一遍，即：“先是進(jìn)入cd ~/siesta/obj
執(zhí)行../Src/ob ...

只需要串行的話，編譯器FC=gfortran，不要選擇為mpif90，和MPI有關(guān)的lib都可以#掉。

你給出來的問題
root@localhost h2o]# make
>>>> Running h2o test...
==> Copying pseudopotential file for H...
==> Copying pseudopotential file for O...
==> Running SIESTA as ../../../siesta
/bin/sh: ../../../siesta: No such file or directory
make: *** [completed_work] Error 127
從情況上看，應(yīng)該是test的時(shí)候腳本未找到你siesta程序的位置，我剛開始認(rèn)為你編譯可能沒成功。你編譯過程中make后是否報(bào)錯(cuò)？并且檢查一下你編譯出來siesta生成的位置。如果你的siesta位置不是h2o那個(gè)目錄的../../../，那么你可以修改h2o下的那個(gè)makefile指明siesta的路徑。

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9樓2013-12-04 23:41:43

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9樓: Originally posted by 卡開發(fā)發(fā) at 2013-12-04 23:41:43
只需要串行的話，編譯器FC=gfortran，不要選擇為mpif90，和MPI有關(guān)的lib都可以#掉。

你給出來的問題
rootlocalhost h2o]# make
>>>> Running h2o test...
==> Copying pseudopotential f ...

非常感謝! 金幣不知道怎么給.先送個(gè)紅花。能弄清楚了再補(bǔ)上金幣！
我明白問題出在哪里了！是路徑！
我的makefile是：
“#
# Single-test makefile
#
name=h2o
#
include ../test.mk”
我不知道哪個(gè)地方改成siesta的路徑,于是我把整個(gè)文件夾"h2o"換了一個(gè)位置，然后發(fā)現(xiàn)make成功了！
于是問題變成了：如何在不改文件夾路徑而是改makefile的siesta路徑，能make成功？

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10樓2013-12-05 16:51:22

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