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liutao_jlu822

銀蟲 (小有名氣)

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[交流] 動(dòng)力學(xué)NPT壓力

最近用vasp 5.2.12做NPT的MD模擬以下是INCAR
ISTART = 0
INIWAV = 1

ISYM = 0

ENCUT = 800
ENAUG = 2400
PREC = high
MAXMIX = 40
EDIFF = 0.001
NELMIN = 4

ISMEAR = -1
SIGMA = 0.172

IBRION = 0
LREAL = .FALSE.

ALGO = Very Fast

NSW = 1000

LCHARG = .FALSE.
LWAVE = .TURE.
TEBEG = 2000.0
TEEND = 2000.0

SMASS = 0
NBLOCK = 50
POTIM = 1.0

PSTRESS = 1500
ISIF = 3

PMASS = 20

DMALGO = 3
LANGEVIN_GAMMA = 50,50,50
LANGEVIN_GAMMA_L = 50

提取OUTCAT中stress信息如下

in kB 4172.66112 3902.39396 4400.48371 0.75775 0.00033 -0.00129
in kB 4175.23568 3903.55126 4397.35739 -1.09890 4.17513 0.79122
in kB 4177.58431 3902.41118 4388.94827 -1.87095 8.17570 1.01140
in kB 4180.84173 3901.55583 4377.15279 -2.23297 11.91227 0.64589
in kB 4183.17536 3899.89882 4361.25600 -1.97631 15.42282 -0.17552
in kB 4184.61089 3897.95280 4341.75406 -1.03387 18.65903 -1.31153
in kB 4184.97713 3895.89317 4319.14836 0.60726 21.60255 -2.56697
in kB 4183.96156 3893.68236 4293.78485 2.78659 24.21068 -3.74790
in kB 4181.50387 3891.18446 4266.20603 5.28728 26.42985 -4.67963
in kB 4177.77326 3888.18529 4237.08118 7.81475 28.20301 -5.22024
in kB 4173.13620 3884.51263 4207.21849 10.00879 29.47044 -5.27320

我的問題是
為什么設(shè)置PSTRESS = 1500，但是OUTCAR卻給出壓力在4000左右？

如果只是普通的結(jié)構(gòu)優(yōu)化，設(shè)置IBRION = 2，stress信息如下

in kB 4164.18638 3891.83071 4390.16931 -0.00023 0.00009 0.00002
in kB 3839.38224 3590.92924 4038.54882 0.00163 -0.00007 -0.00002
in kB 2996.27502 2807.91069 3130.59147 -0.00024 -0.00002 -0.00013
in kB 1778.69087 1669.38225 1831.87127 -0.00002 0.00001 -0.00004
in kB 1497.67446 1404.55014 1534.81292 0.00048 -0.00002 0.00006
in kB 1448.12627 1357.76865 1482.58460 0.00035 0.00002 -0.00004
in kB 1449.96058 1361.96624 1487.14790 0.00273 0.00009 0.00010
in kB 1456.56412 1374.89207 1499.80704 0.00234 -0.00000 0.00001
in kB 1477.63406 1406.94473 1524.00978 -0.00029 -0.00005 0.00003
in kB 1548.88679 1500.03893 1572.79441 -0.00230 -0.00005 0.00007
in kB 1803.80977 1850.93418 1743.05711 -0.00311 0.00001 0.00025

....

in kB 1500.08061 1499.76833 1499.91247 0.00031 -0.00003 -0.00000
in kB 1499.86822 1499.56459 1499.69498 -0.00016 -0.00000 0.00002
in kB 1499.96526 1499.79712 1500.02728 0.00052 -0.00003 0.00000
in kB 1500.17449 1500.27199 1500.67246 0.00043 -0.00001 -0.00002
in kB 1499.88523 1500.04832 1500.34787 -0.00023 -0.00001 -0.00003
in kB 1499.30292 1499.59149 1499.70567 -0.00008 -0.00000 -0.00003
in kB 1499.58503 1499.88517 1499.85329 -0.00014 0.00002 -0.00004
in kB 1500.29745 1500.58586 1500.17384 -0.00009 0.00002 0.00000
in kB 1500.10129 1500.25323 1499.81734 0.00016 0.00004 0.00002
in kB 1500.08360 1500.17931 1499.73520 0.00020 0.00001 0.00001
in kB 1500.07581 1500.15166 1499.90178 0.00048 0.00001 -0.00001
in kB 1500.07394 1500.13570 1500.00074 0.00028 0.00001 0.00000

這個(gè)壓力是正確的。

為什么做動(dòng)力學(xué)的時(shí)候（IBRION = 0）壓力顯示為4000多？
多謝

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1樓 2013-12-09 20:17:09

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銳利的碎片

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liutao_jlu822(金幣+2): 謝謝參與

計(jì)算時(shí)候用壓力下的平衡結(jié)構(gòu)做初始結(jié)構(gòu)，一般MD壓力平衡會(huì)比較困難。

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2樓2013-12-09 20:33:38

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liutao_jlu822

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2樓: Originally posted by 銳利的碎片 at 2013-12-09 20:33:38
計(jì)算時(shí)候用壓力下的平衡結(jié)構(gòu)做初始結(jié)構(gòu)，一般MD壓力平衡會(huì)比較困難。

謝謝回復(fù)。
MD中使用的初始結(jié)構(gòu)就是該壓力的平衡結(jié)構(gòu)。
我測(cè)試了一下，不管Pstress設(shè)置為多少，OUTCAR中的壓力都顯示為4000左右。

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5樓2013-12-09 20:52:00

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假大空

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7樓2013-12-09 21:07:56

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dxcharlary

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liutao_jlu822: 金幣+5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖 2013-12-10 15:04:22

明顯你給的結(jié)構(gòu)是400GPa左右的。
樓主你把relax之后的CONTCAR作為初始結(jié)構(gòu)就好了。另外感覺是不是樓主的POTIM = 1.0設(shè)的太小了，那個(gè)單位是fs。
喔，我剛才查了一下，vasp不能做vc-md（cpmd），那估計(jì)就沒辦法做NPT系綜了。
注意下面那個(gè)manual最下面的mind：
http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp/vasp/IBRION_0.html

[ Last edited by dxcharlary on 2013-12-10 at 09:01 ]

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18樓2013-12-10 08:53:45

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liutao_jlu822: 金幣+5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖 2013-12-10 15:04:53

引用回帖:

18樓: Originally posted by dxcharlary at 2013-12-10 08:53:45
明顯你給的結(jié)構(gòu)是400GPa左右的。
樓主你把relax之后的CONTCAR作為初始結(jié)構(gòu)就好了。另外感覺是不是樓主的POTIM = 1.0設(shè)的太小了，那個(gè)單位是fs。
喔，我剛才查了一下，vasp不能做vc-md（cpmd），那估計(jì)就沒辦法做N ...

5.2.12加上-Dtbdyn編譯后可以算npt，lz的INCAR是對(duì)的。

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19樓2013-12-10 10:21:33

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liutao_jlu822: 金幣+1, 給個(gè)紅包，謝謝回帖 2013-12-10 15:05:52

引用回帖:

19樓: Originally posted by 銳利的碎片 at 2013-12-10 10:21:33
5.2.12加上-Dtbdyn編譯后可以算npt，lz的INCAR是對(duì)的。...

請(qǐng)問vasp 4.6 能跑NPT嗎？難道只能跑NVT？謝了啊

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20樓2013-12-10 11:35:54

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dxcharlary

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引用回帖:

19樓: Originally posted by 銳利的碎片 at 2013-12-10 10:21:33
5.2.12加上-Dtbdyn編譯后可以算npt，lz的INCAR是對(duì)的。...

嗯，看起來是這樣。
http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp ... vin_thermostat.html
不過1fs的時(shí)間間隔個(gè)人感覺還是有點(diǎn)短。

[ Last edited by dxcharlary on 2013-12-10 at 11:46 ]

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21樓2013-12-10 11:44:54

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我查了一下我給的結(jié)構(gòu)是relax之后的結(jié)構(gòu)，不應(yīng)該是400GPa的結(jié)構(gòu)

Mind: At the moment only constant volume MD's are possible.
我看了一下體積，果然是constant volume。但是
在vasp manual 里面也有NPT的介紹，說只要是ISIF=3就可以改變體積和形狀
http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp ... vin_thermostat.html

不知道怎么回事？

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23樓2013-12-10 15:45:11

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23樓: Originally posted by liutao_jlu822 at 2013-12-10 15:45:11
我查了一下我給的結(jié)構(gòu)是relax之后的結(jié)構(gòu)，不應(yīng)該是400GPa的結(jié)構(gòu)

Mind: At the moment only constant volume MD's are possible.
我看了一下體積，果然是constant volume。但是
在vasp manual 里面也有NPT的 ...

看19樓。

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24樓2013-12-10 18:33:21

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24樓: Originally posted by 銳利的碎片 at 2013-12-10 18:33:21
看19樓。...

Thanks

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25樓2013-12-10 18:56:34

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體積終于可以變化，應(yīng)該是 -Dtbdyn 編譯問題，但是新問題有出現(xiàn)了。
我要在T=2000K, P=150GPa下進(jìn)行模擬NPT系宗，但是在OUTCAR中系統(tǒng)壓力無限制的增加到5000GPa，體積也縮小到不合理的范圍。
以前用lammps做經(jīng)典動(dòng)力學(xué)NPT模擬的時(shí)候還真沒碰上這種情況。大家看看那出錯(cuò)了呢？謝謝

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26樓2013-12-11 16:36:11

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