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vlang木蟲 (正式寫手)
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[求助]
如何用MS計算分子晶體的晶格能
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| 如題，現(xiàn)在需要用MS中的DFTB+, Dmol3等方法計算一個分子晶體的晶格能，該怎么做？求各位指導(dǎo)啊！小弟拜謝�。�！ |
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
vlang: 金幣+10, ★★★★★最佳答案, 謝謝！ 2013-12-11 12:24:40
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晶格能計算公式參見： Modeling the Crystal Shape of Polar Organic Materials Prediction of Urea crystals Grown from Polar and Nonpolar Solvents. Crystal Growth & Design, Vol. 1, No. 6, 2001 1.計算晶胞的能量(為了精確把單個晶胞擴(kuò)展為超晶胞再計算)； 2.把單個分子放在真空盒子中，計算能量 3.晶格能=晶胞中單個分子的能量-真空層中分子的能量 |
2樓2013-12-10 14:10:58
vlang
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3樓2013-12-10 23:09:23
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【答案】應(yīng)助回帖
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1.理論上越大約好，比如6*6*6的，為了使計算的結(jié)果可靠，一般要做尺寸的收斂性驗(yàn)證，即取一系列大小的尺寸，算出能量，看能量在哪個尺度上收斂。 2.建一個和步驟1一樣大小的真空盒子，自己畫出分子，放入盒子中，算能量。具體什么模塊，得看你是否有后續(xù)計算，后續(xù)計算用了什么理論，這里就用什么，比如后續(xù)計算基于量子力學(xué)的，那這里計算的時候，就用量子力學(xué)的模塊，如Dmol3或者CASTEP；后續(xù)計算是基于分子力(動力)學(xué)，那這里也用相應(yīng)的模塊。 不知道你計算晶格能是什么，常見研究者用該能量，來驗(yàn)證他們在分子動力學(xué)計算中所用力場的有效性。 |
4樓2013-12-11 08:37:36
cg陳
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5樓2013-12-11 17:52:18
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6樓2013-12-12 11:12:59
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