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vlang木蟲 (正式寫手)
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[求助]
如何用MS計算分子晶體的晶格能
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| 如題,現(xiàn)在需要用MS中的DFTB+, Dmol3等方法計算一個分子晶體的晶格能,該怎么做?求各位指導(dǎo)。⌒〉馨葜x。! |
MS計算模擬 |
主管區(qū)長 (職業(yè)作家)
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晶格能計算公式參見: Modeling the Crystal Shape of Polar Organic Materials Prediction of Urea crystals Grown from Polar and Nonpolar Solvents. Crystal Growth & Design, Vol. 1, No. 6, 2001 1.計算晶胞的能量(為了精確把單個晶胞擴(kuò)展為超晶胞再計算); 2.把單個分子放在真空盒子中,計算能量 3.晶格能=晶胞中單個分子的能量-真空層中分子的能量 |

木蟲 (正式寫手)
主管區(qū)長 (職業(yè)作家)
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專家經(jīng)驗: +1059 |
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1.理論上越大約好,比如6*6*6的,為了使計算的結(jié)果可靠,一般要做尺寸的收斂性驗證,即取一系列大小的尺寸,算出能量,看能量在哪個尺度上收斂。 2.建一個和步驟1一樣大小的真空盒子,自己畫出分子,放入盒子中,算能量。具體什么模塊,得看你是否有后續(xù)計算,后續(xù)計算用了什么理論,這里就用什么,比如后續(xù)計算基于量子力學(xué)的,那這里計算的時候,就用量子力學(xué)的模塊,如Dmol3或者CASTEP;后續(xù)計算是基于分子力(動力)學(xué),那這里也用相應(yīng)的模塊。 不知道你計算晶格能是什么,常見研究者用該能量,來驗證他們在分子動力學(xué)計算中所用力場的有效性。 |

鐵桿木蟲 (著名寫手)
木蟲 (正式寫手)
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