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liu_chen_na新蟲 (初入文壇)
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[求助]
蛋白柔性殘基設置之后非整數(shù)電荷問題？
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請教大家一個問題： Autodock4: Flexible residues項中把蛋白中ASP,GLU等氨基酸設置為柔性殘基，然后分別保存為_flex.pdbqt和_rigid.pdbqt文件，但這兩個pdbqt文件中ASP,GLU等氨基酸是不完整的，它們所帶的電荷也不為整數(shù)，之后Grid項中Macromolecule打開_rigid.pdbqt文件也提示有氨基酸帶非整數(shù)電荷，蛋白非整數(shù)電荷。 請問下這種情況該怎么處理，不處理對對接結果有何影響？ 此外，Grid項中Get map tpyes中需要選擇Choose flexresidue嗎？中文教程上沒有選擇。 |
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