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liangyan5240金蟲 (著名寫手)
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[求助]
microRNA命名以及數(shù)據(jù)分析 已有1人參與
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| 我想請(qǐng)教一下這個(gè)miR-XX與miR-XX-3p(或5p)的區(qū)別,因?yàn)槲易龅男酒Y(jié)果都是帶3p或5p的,但是去pubmed查文獻(xiàn)有miR-XX的結(jié)果,也有miR-XX-3P的結(jié)果,如果我想在論文討論部分分析miR-XX-3P的話,可以引用miR-XX的文獻(xiàn)嗎?十分感謝! |
鐵桿木蟲 (正式寫手)
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"miR-xx與miR-xx-3p僅在基因組位置上鄰近,其序列可以沒有關(guān)系,種子序列也不同?梢哉J(rèn)為是兩個(gè)不同的miRNA。 可以在www.targetscan.org或miRbase.org上查找。 在miRbase上查找miR-xx,會(huì)將查找結(jié)果按基因座位的方式顯示鏈接,點(diǎn)擊進(jìn)去后,miR-xx-5p 和 miR-xx-3p 的信息都在里面(如果都存在的話)。由于歷史原因,有時(shí)候miR-xx先確定命名,然后才在基因組上座位上確定是miR-xx-5p還是miR-xx-3p,所以會(huì)存在miR-xx = miR-xx-3p的情況,這種情況在miRbase上都標(biāo)注得很清楚。" ——引自XX園 最早在命名miRNA時(shí) 將已命名的miR-XX互補(bǔ)鏈上的miRNA稱作miR-XX* 后來對(duì)microRNA命名進(jìn)行規(guī)范后 將它們改成miR-XX-3p/-5p 因此你需要到數(shù)據(jù)庫(kù)中 去查看你感興趣miRNA的具體序列 確定文獻(xiàn)中這個(gè)miRNA到底是指-3p還是-5p 要具體問題具體分析 不能一概而論 |
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