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liangyan5240金蟲 (著名寫手)
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[求助]
microRNA命名以及數(shù)據(jù)分析 已有1人參與
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| 我想請教一下這個miR-XX與miR-XX-3p（或5p)的區(qū)別，因?yàn)槲易龅男酒Y(jié)果都是帶3p或5p的，但是去pubmed查文獻(xiàn)有miR-XX的結(jié)果，也有miR-XX-3P的結(jié)果，如果我想在論文討論部分分析miR-XX-3P的話，可以引用miR-XX的文獻(xiàn)嗎？十分感謝！ |
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Davidzjy
鐵桿木蟲 (正式寫手)
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【答案】應(yīng)助回帖
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liangyan5240: 金幣+50, ★★★★★最佳答案, 十分感謝！ 2013-12-22 08:20:46
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"miR-xx與miR-xx-3p僅在基因組位置上鄰近，其序列可以沒有關(guān)系，種子序列也不同�？梢哉J(rèn)為是兩個不同的miRNA。 可以在www.targetscan.org或miRbase.org上查找。 在miRbase上查找miR-xx，會將查找結(jié)果按基因座位的方式顯示鏈接，點(diǎn)擊進(jìn)去后，miR-xx-5p 和 miR-xx-3p 的信息都在里面（如果都存在的話）。由于歷史原因，有時候miR-xx先確定命名，然后才在基因組上座位上確定是miR-xx-5p還是miR-xx-3p，所以會存在miR-xx = miR-xx-3p的情況，這種情況在miRbase上都標(biāo)注得很清楚。" ——引自XX園 最早在命名miRNA時 將已命名的miR-XX互補(bǔ)鏈上的miRNA稱作miR-XX* 后來對microRNA命名進(jìn)行規(guī)范后 將它們改成miR-XX-3p/-5p 因此你需要到數(shù)據(jù)庫中 去查看你感興趣miRNA的具體序列 確定文獻(xiàn)中這個miRNA到底是指-3p還是-5p 要具體問題具體分析 不能一概而論 |
2樓2013-12-21 11:29:50
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