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swfssss新蟲 (初入文壇)
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[求助]
我要做電子克隆 已有1人參與
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生物信息學(xué)的作業(yè)，要求電子克隆某個物種的某個未知基因，關(guān)鍵是我不知道要克隆什么基因！ 我就想請問各位大俠，我該如何選擇我要克隆的基因？我怎么知道我要克隆的那個基因是否已經(jīng)有人克�。▓蟮溃┻^了？ 希望各位前輩賜教，感激不盡！ |
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yudaoqian88
至尊木蟲 (知名作家)
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wizardfan: 金幣+2, 應(yīng)助指數(shù)+1, 謝謝參與 2014-01-06 05:16:12
swfssss: 金幣+10, ★★★很有幫助, 謝謝樓主的熱心解答 2014-01-06 18:07:07
wizardfan: 金幣+2, 應(yīng)助指數(shù)+1, 謝謝參與 2014-01-06 05:16:12
swfssss: 金幣+10, ★★★很有幫助, 謝謝樓主的熱心解答 2014-01-06 18:07:07
 我是個外行，對嚴(yán)格的電子克隆內(nèi)容缺乏了解！僅就個人理解加以敘述！對于新基因，我個人理解分為兩類，以物種A、B加以區(qū)分。就單獨的A物種而言，沒有報道的就是新基因;同時對比A,B兩個物種，同一個基因在A中有報道，但是在B中沒有，那么這個基因在B中也是個新基因，也符合樓主的要求（僅僅是個人理解哈）對于克隆克隆，我向樓主推薦一個方法，不知道是否合適，就是“同源克隆法” 比如說樓主現(xiàn)在的目標(biāo)物種是A，樓主可以在A以外的其他物種中尋找目標(biāo)基因，比如說B，或者其他模式生物，找相關(guān)途徑感興趣的基因，什么基因都可以。 驗證這個基因是否在目標(biāo)物種中已被研究，可以利用NCBI的BLAST,把序列粘進(jìn)去，直接運(yùn)行，看看是否在目標(biāo)序列有高度同源的物種即可！如果目標(biāo)物種有參考全基因組序列，那么直接拿那個基因與目標(biāo)物種全基因組做比對，或者比對蛋白，蛋白相似性40%以上的都可以理解為具有同源性。 如果目標(biāo)物種沒有參考序列，我就不知道這個電子克隆要做到什么了，通常的方式是，比對除目標(biāo)物種以為的其他物種的目標(biāo)基因，找基因保守序列，然后根據(jù)保守序列設(shè)計引物，用目標(biāo)物種的DNA做模板擴(kuò)增，可以直接拿到目標(biāo)基因在目標(biāo)物種中的序列！祝樓主順利，再坐等高手的賜教！ |
2樓2014-01-05 21:18:45
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