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junjun0711新蟲 (小有名氣)
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[求助]
小分子很少怎么做虛擬篩選啊��！ 已有2人參與
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| 我有一味中藥，早已應(yīng)用于臨床，治療某病效果很好，只有十五個(gè)成分，老板希望試一試看這些小分子和某病靶點(diǎn)如何作用的，因?yàn)榉肿訑?shù)太少，分子對接后沒有一個(gè)小分子的打分能高于靶點(diǎn)蛋白原配體的打分，根本篩不出，實(shí)驗(yàn)室不是做計(jì)算這塊，我也很菜鳥，希望有前輩能指點(diǎn)指點(diǎn)。 |
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月只藍(lán): 金幣+1, 感謝指導(dǎo)。 2014-01-03 09:16:24
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2樓2014-01-02 17:11:41
junjun0711
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3樓2014-01-02 20:46:49
monsoncupid
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4樓2014-01-02 21:35:09
junjun0711
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5樓2014-01-03 10:21:37
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【答案】應(yīng)助回帖
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月只藍(lán): 金幣+1, 感謝指導(dǎo)。 2014-01-03 17:07:43
月只藍(lán): 金幣+1, 感謝指導(dǎo)。 2014-01-03 17:07:43
| 意思就是一共才十幾個(gè)關(guān)鍵成分，逐個(gè)提取出來，然后與你的靶標(biāo)蛋白相互作用，測定熒光紫外光譜，然后再根據(jù)什么stern-volmer方程之類的算什么猝滅常數(shù)之類之類的，分析一番哪個(gè)組分的相互作用比較強(qiáng)烈，然后存在相互作用的幾個(gè)組分再做分子對接，Cdocker 不行就 flexible docking 、libdock 之類的對接程序挨個(gè)試，看哪個(gè)打分高就搞定了 |
6樓2014-01-03 16:26:12
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7樓2014-01-03 16:53:07
8樓2018-10-09 08:57:57
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