 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 3044 | 回復(fù): 27 | ||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | ||
敏sunflower金蟲 (小有名氣)
|
[求助]
MS建模過程中出錯 已有1人參與
|
|
|
急需各位大俠的幫助！�。。。。。� 我在建立模型時，使用Amorphpus Cell-calculation，沒有選擇optimize geometry，但是仍然出現(xiàn)了與之前求助帖中相同的問題（求助帖鏈接http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=6767208），描述如下：Amorphous Cell calculation completed。但是status：Error。 Error description：Amorphous Cell failed in the NPT dynamics stage。 -Dynamics calculation-Deviation in the enrgy (8.82135*10^7kcal/mol) between successive steps was greater than the specified maximum（50000kcal/mol）。與求助帖中Dynamics calculation-Deviation in the enrgy (83012.9kcal/mol) between successive steps was greater than the specified maximum（50000kcal/mol）的83012.9kcal/mol相比，不選擇optimize geometry時能量偏差為8.82135*10^7kcal/mol，偏差更大了。 我不知道現(xiàn)在應(yīng)該怎么做才能成功建立模型，1.是應(yīng)該在選擇optimize geometry時，將NPT的默認(rèn)值50000kcal/mol修改為90000（大于計(jì)算得到的能量偏差83012.9kcal/mol）。 還是2.不選擇optimize geometry，將NPT的默認(rèn)值50000kcal/mol修改為9*10^7（大于計(jì)算得到的能量偏差83012.9kcal/mol）。 3.或者還有其他方法。 但是如果按照1或2中修改的話就會出現(xiàn)一個問題：將NPT默認(rèn)值50000kcal/mol修改為其他值，是在前面建模過程失敗，并提示能量偏差（給出確定值）大于NPT默認(rèn)值的情況下進(jìn)行的。難道每次建模型都要這樣不斷嘗試修改NPT默認(rèn)值嗎？  |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
336求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
求生物學(xué)調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
08生物與醫(yī)藥專碩初試346找調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
生物學(xué)327，求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
0710生物學(xué)求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
385分 生物學(xué)（071000）求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
材料考研調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
366求調(diào)劑一志愿東北大學(xué)
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
08工科275分求調(diào)劑
已經(jīng)有13人回復(fù)
-
材料工程322分
已經(jīng)有6人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- MS建模需要的數(shù)據(jù)
已經(jīng)有9人回復(fù)
- MS建立Co3O4模型
已經(jīng)有25人回復(fù)
- MS建模時對模型結(jié)構(gòu)優(yōu)化的目的以及參數(shù)如何設(shè)置
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 關(guān)于MS 中聲子計(jì)算問題，優(yōu)化問題
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 關(guān)于MS中.cell文件的問題
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 請問用MS怎么建模C3N4?
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 如何利用計(jì)算結(jié)果在ms建模
已經(jīng)有6人回復(fù)
- MS建模問題求助
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 有關(guān)MS 的建模 優(yōu)化及計(jì)算的一些問題
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 請教MS建模時如何給一個單胞的表面加上真空層？
已經(jīng)有7人回復(fù)
- MS優(yōu)化過程中如何選擇K點(diǎn)？？？？？？？
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 求助MS建模時化學(xué)鍵的替換操作
已經(jīng)有10人回復(fù)
- MS安裝后的模型不能轉(zhuǎn)動等問題
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 【求助】近紅外光譜儀檢驗(yàn)方法建立過程中，建模后的模型校正和驗(yàn)證分別應(yīng)如何開展
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【求助】按照ICSD的數(shù)據(jù)在MS中建模遇到原子相距太近怎么處理?
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 【求助】納米線MS建模
已經(jīng)有20人回復(fù)
- 【求助】MS建模導(dǎo)入lammps問題求救
已經(jīng)有14人回復(fù)
- 【求助】MS建模替換原子
已經(jīng)有24人回復(fù)
cg陳
鐵桿木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 76 (初中生)
- 金幣: 6627.2
- 散金: 46
- 紅花: 2
- 帖子: 1253
- 在線: 445.4小時
- 蟲號: 874350
- 注冊: 2009-10-16
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
5樓2014-01-11 14:59:47
cg陳
鐵桿木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 76 (初中生)
- 金幣: 6627.2
- 散金: 46
- 紅花: 2
- 帖子: 1253
- 在線: 445.4小時
- 蟲號: 874350
- 注冊: 2009-10-16
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
2樓2014-01-10 13:18:08
| 頂一下，感謝分享！ |
3樓2014-01-10 14:19:20
敏sunflower
金蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 1144.8
- 散金: 17
- 紅花: 2
- 帖子: 179
- 在線: 116.2小時
- 蟲號: 2088951
- 注冊: 2012-10-27
- 性別: MM
- 專業(yè): 化學(xué)反應(yīng)工程
4樓2014-01-10 20:41:46
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 292求調(diào)劑 +17 | 木蟲er12138 2026-04-01 | 17/850 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 265求調(diào)劑 +11 | yelck 2026-04-01 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 362求調(diào)劑 +13 | 西南交材料專碩3 2026-03-31 | 13/650 |
|
|
[考研] 085601一志愿中山大學(xué)深圳材料工程330求調(diào)劑 +6 | pipiver 2026-03-30 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 0856，材料與化工321分求調(diào)劑 +13 | 大饞小子 2026-03-27 | 14/700 |
|
|
|
[碩博家園] 考研調(diào)劑 +5 | 駱駝男人 2026-04-01 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 土木304求調(diào)劑 +3 | 兔突突突， 2026-03-31 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0805求調(diào)劑 +6 | 是水分 2026-03-31 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 考研生物與醫(yī)藥調(diào)劑 +7 | 鐵憨憨123425 2026-03-31 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 【調(diào)劑】一志愿廈大生物與醫(yī)藥調(diào)劑 +3 | Echo蝦米 2026-03-31 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿食品科學(xué)與工程083200求調(diào)劑 +4 | XQTJZ 2026-03-30 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 370求調(diào)劑 +3 | 080700調(diào)劑 2026-03-30 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 本科211總分289，08工學(xué)真心求調(diào)劑 +3 | utopiaE 2026-03-30 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 材料化工340求調(diào)劑 +3 | jhx777 2026-03-30 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 293求調(diào)劑 +3 | 末未mm 2026-03-30 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 303求調(diào)劑 +7 | DLkz1314. 2026-03-30 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 305求調(diào)劑 +8 | RuiFairyrui 2026-03-28 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 340求調(diào)劑 +5 | jhx777 2026-03-27 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 08開頭275求調(diào)劑 +4 | 拉誰不重要 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿吉大071010，316分求調(diào)劑 +3 | xgbiknn 2026-03-27 | 3/150 |
|