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zhangxingc鐵桿木蟲 (著名寫手)
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[求助]
救急:如何確定同一個種的兩株菌是否為同一株菌 已有7人參與
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如題,也可理解為我從網(wǎng)上買過兩次標(biāo)準(zhǔn)菌,我該通過分子生物學(xué)中哪個方法確認(rèn)這兩株是同一株菌。 請大家?guī)蛶兔? |
實驗初步 |

金蟲 (正式寫手)

金蟲 (正式寫手)
| 我覺得這個類似菌株鑒定,我以前做過細(xì)菌的,一般是克隆保守序列16S,擴(kuò)增產(chǎn)物送去測序,測序結(jié)果去NCBI進(jìn)行Blast,可以查出屬于哪一種屬,如果你是對兩株菌進(jìn)行鑒定看是否一樣,完全可以直接用DNAman直接比對,如果差異堿基不超過3個既可以看成是一株菌 |

金蟲 (正式寫手)

木蟲 (著名寫手)
鐵桿木蟲 (著名寫手)

鐵桿木蟲 (著名寫手)

金蟲 (正式寫手)
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1、參考伯杰氏手冊或文獻(xiàn),做幾個重要的理化特征方面的比較; 2. 細(xì)菌的話,做個16S序列或其他保守基因或MLSA的比較;真菌的話,ITS是個不錯的選擇; 3. 參考文獻(xiàn),看是否有針對該菌的特異性PCR引物,可以做一個簡單的PCR實驗; 4. 使用幾種內(nèi)切酶進(jìn)行酶切,電泳比較帶型,看是否一致; 5. 其他分子標(biāo)記; 方法很多,綜合幾個證據(jù),基本上能說明兩者是否同一來源(“兩株菌是同一株菌”的說法不太合適)。 |

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