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cxfans鐵桿木蟲 (著名寫手)
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[求助]
NCBI上傳序列的問題 急 切
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擴(kuò)增了一段基因部分片段（cDNA擴(kuò)增），bankit上傳，到feature階段，因?yàn)槭强煞g基因，選擇cDS，但粘貼上氨基酸序列后，出現(xiàn)錯誤，說我的核酸序列不夠長，不足以翻譯蛋白，請上傳正確序列�？墒俏覕U(kuò)增的就是partial sequence。不知如何進(jìn)行了，我的核酸序列450bp。急求相關(guān)大神幫忙�。。〈蟀徒饚潘蜕� [ Last edited by liusir3836 on 2014-1-25 at 20:58 ] |
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cxfans
鐵桿木蟲 (著名寫手)
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2樓2014-01-25 16:31:31
seizetheday
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【答案】應(yīng)助回帖
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在feature階段，是要對核酸序列做出注釋，即從第幾個(gè)堿基到第幾個(gè)堿基編碼的是什么蛋白，先在txt文件中注釋好了，再上傳上去即可，如果出現(xiàn)錯誤會提示。下面是一個(gè)例子： >Feature Seq1 <75 104 CDS 167 200 253 >546 product histone codon_start 2 <75 104 mRNA 167 200 253 >546 product histone >Feature Seq2 <75 104 CDS 167 200 253 >546 product histone codon_start 2 <75 104 mRNA 167 200 253 >546 product histone >Feature Seq3 <22 51 CDS 113 >440 product histone codon_start 1 <22 51 mRNA 113 >440 product histone |
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