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zhuimeng08銀蟲 (正式寫手)
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gromacs 處理小分子配體,其電荷怎么處理? 已有1人參與
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我用gromacs 做分子動力學,用http://davapc1.bioch.dundee.ac.uk/cgi-bin/prodrg/run.html 這個網址算出的小分子配體top文件的電荷是錯誤的。 所以又用了高斯計算,但是高斯中是包含配體小分子的非極性氫的,但是此網站計算的電荷不包括,(高斯計算的小分子配體的非極性氫的電荷如何處理?)請問這個問題,怎么解決?? |
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