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zhuimeng08銀蟲 (正式寫手)
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[求助]
gromacs 處理小分子配體，其電荷怎么處理？ 已有1人參與
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我用gromacs 做分子動(dòng)力學(xué)，用http://davapc1.bioch.dundee.ac.uk/cgi-bin/prodrg/run.html 這個(gè)網(wǎng)址算出的小分子配體top文件的電荷是錯(cuò)誤的。 所以又用了高斯計(jì)算，但是高斯中是包含配體小分子的非極性氫的，但是此網(wǎng)站計(jì)算的電荷不包括，（高斯計(jì)算的小分子配體的非極性氫的電荷如何處理？）請問這個(gè)問題，怎么解決？？ |
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xueer小雯
金蟲 (初入文壇)
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5樓2014-03-12 11:00:09
zhuimeng08
銀蟲 (正式寫手)
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