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zhuimeng08銀蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
gromacs 處理小分子配體,其電荷怎么處理? 已有1人參與
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我用gromacs 做分子動(dòng)力學(xué),用http://davapc1.bioch.dundee.ac.uk/cgi-bin/prodrg/run.html 這個(gè)網(wǎng)址算出的小分子配體top文件的電荷是錯(cuò)誤的。 所以又用了高斯計(jì)算,但是高斯中是包含配體小分子的非極性氫的,但是此網(wǎng)站計(jì)算的電荷不包括,(高斯計(jì)算的小分子配體的非極性氫的電荷如何處理?)請(qǐng)問(wèn)這個(gè)問(wèn)題,怎么解決?? |
銀蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
金蟲(chóng) (初入文壇)
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